RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 HIP1O00291 1037 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 RBSNQ9H1K0 784 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF609O15014 1411 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 MCTP1Q6DN14 999 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 FSD1Q9BTV5 496 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO3Q9UK99 471 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-204ENST00000352260 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 CAMTA2O94983 1202 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 NEK4P51957 841 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 CTSWP56202 376 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 FAM227BQ96M60 508 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 HAUS7Q99871 368 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 MBD3O95983 291 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.151e-9■■■■□ 21.7
SPNS1-204ENST00000352260 TIMM10P62072 90 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 PTH1RQ03431 593 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 SNRKQ9NRH2 765 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 PDE8AO60658 829 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 GREM2Q9H772 168 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 A0A0D9SFI3 127 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1B0GUL7 405 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 ITGA6P23229 1130 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 MYH3P11055 1940 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 SUSD4Q5VX71 490 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 MED23Q9ULK4 1368 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 MCM2P49736 904 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 RASEFQ8IZ41 740 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 KLHL34Q8N239 644 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 NHSQ6T4R5 1651 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 PARP10Q53GL7 1025 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 AK7Q96M32 723 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 KCNB2Q92953 911 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 BCORQ6W2J9 1755 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 GPT2Q8TD30 523 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 BTAF1O14981 1849 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 KCNQ4P56696 695 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 MAP4K1Q92918 833 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 TMX3Q96JJ7 454 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 FAM177BA6PVY3 158 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 ADORA1P30542 326 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 DMTNQ08495 405 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 NECTIN1Q15223 517 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 METTL24Q5JXM2 366 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 XAGE2Q96GT9 111 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 GOLIM4O00461 696 aa22.16■■□□□ 1.14
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