RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
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TM7SF3-201ENST00000343028 BRF1Q92994 677 aa23.05■■□□□ 1.28
TM7SF3-201ENST00000343028 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.05■■□□□ 1.28
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TM7SF3-201ENST00000343028 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.04■■□□□ 1.28
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TM7SF3-201ENST00000343028 KRT32Q14532 448 aa23■■□□□ 1.27
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TM7SF3-201ENST00000343028 KIF6Q6ZMV9 814 aa23■■□□□ 1.27
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TM7SF3-201ENST00000343028 WASHC4Q2M389 1173 aa22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3-201ENST00000343028 GTF3C6Q969F1 213 aa22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3-201ENST00000343028 KRT85P78386 507 aa22.98■■□□□ 1.27
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TM7SF3-201ENST00000343028 XAGE2Q96GT9 111 aa22.98■■□□□ 1.27
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TM7SF3-201ENST00000343028 OSBP2Q969R2 916 aa22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3-201ENST00000343028 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.97■■□□□ 1.27
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TM7SF3-201ENST00000343028 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.96■■□□□ 1.27
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TM7SF3-201ENST00000343028 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3-201ENST00000343028 E7EWF7 191 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-201ENST00000343028 H3BQV1 296 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-201ENST00000343028 STARD3NLO95772 234 aa22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.94■■□□□ 1.26
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TM7SF3-201ENST00000343028 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.94■■□□□ 1.26
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TM7SF3-201ENST00000343028 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3-201ENST00000343028 CIAO1O76071 339 aa22.92■■□□□ 1.26
TM7SF3-201ENST00000343028 METTL24Q5JXM2 366 aa22.92■■□□□ 1.26
TM7SF3-201ENST00000343028 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TM7SF3-201ENST00000343028 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.269e-6■□□□□ 10.5
TM7SF3-201ENST00000343028 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.92■■□□□ 1.26
TM7SF3-201ENST00000343028 ITGA6P23229 1130 aa22.92■■□□□ 1.26
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