RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 LMNB1P20700 586 aa22.16■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 MASTLQ96GX5 879 aa22.16■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 NFKBIEO00221 500 aa22.15■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 PDE4AP27815 886 aa22.15■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 PRELPP51888 382 aa22.15■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.15■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.14■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 GPATCH3Q96I76 525 aa22.14■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 EYA2O00167 538 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 FAM161AQ3B820 660 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 NLRP3Q96P20 1036 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 SLX4Q8IY92 1834 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 AOX1Q06278 1338 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 NPR1P16066 1061 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 ITGA6P23229 1130 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 GPR108Q9NPR9 543 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 COL4A1P02462 1669 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 CACNA1SQ13698 1873 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 SIL1Q9H173 461 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 GREM2Q9H772 168 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 CEP350Q5VT06 3117 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 CRY2Q49AN0 593 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 TAF1P21675 1872 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 MX1P20591 662 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 STAP2Q9UGK3 403 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 SPEF2Q9C093 1822 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 SASH1O94885 1247 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 SOGA3Q5TF21 947 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 SKAP1Q86WV1 359 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE4-201ENST00000324444 ERC2O15083 957 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 TOMM70O94826 608 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 PDE1AP54750 535 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 A0A1B0GUL6 1792 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 AACSQ86V21 672 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 RRAGCQ9HB90 399 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 HSPA6P17066 643 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 ALDH1B1P30837 517 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC93Q567U6 631 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 TTC22Q5TAA0 569 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 GLTPD2A6NH11 291 aa22.04■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 TFCP2Q12800 502 aa22.04■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 TNNI3KQ59H18 835 aa22.04■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.04■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.04■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 OLFM4Q6UX06 510 aa22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 BCL11AQ9H165 835 aa22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.03■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 METTL24Q5JXM2 366 aa22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.02■■□□□ 1.12
SYNE4-201ENST00000324444 LRRC24Q50LG9 513 aa22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 CASC1Q6TDU7 716 aa22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 BACH2Q9BYV9 841 aa22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.99■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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