RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295083.7

PQLC3-201, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PQLC3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-201ENST00000295083 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 C7orf43Q8WVR3 580 aa30.64■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 MINPP1Q9UNW1 487 aa30.64■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa30.63■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 CIAO1O76071 339 aa30.63■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.63■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 PPP4R2Q9NY27 417 aa30.63■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 APBB1O00213 710 aa30.62■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 FBXO3Q9UK99 471 aa30.62■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.62■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 SP8Q8IXZ3 490 aa30.61■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.61■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 C21orf2O43822 256 aa30.61■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 SASH1O94885 1247 aa30.61■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 CHRNDQ07001 517 aa30.61■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 BCS1LQ9Y276 419 aa30.61■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 IL15P40933 162 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 TMC4Q7Z404 712 aa30.6■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 TAF5LO75529 589 aa30.59■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 METTL24Q5JXM2 366 aa30.58■■■□□ 2.49
PQLC3-201ENST00000295083 TFCP2Q12800 502 aa30.57■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 VGLL2Q8N8G2 317 aa30.57■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 LRRC37AA6NMS7 1700 aa30.57■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 MROH5Q6ZUA9 1318 aa30.57■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 SNAP23O00161 211 aa30.57■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 GPSM2P81274 684 aa30.57■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa30.57■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 SMC5Q8IY18 1101 aa30.57■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 GCC1Q96CN9 775 aa30.55■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.55■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 RHPN1Q8TCX5 695 aa30.54■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 CEP126Q9P2H0 1117 aa30.54■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 KDM2BQ8NHM5 1336 aa30.54■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 RAB11FIP3O75154 756 aa30.54■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 PDE8BO95263 885 aa30.54■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 BCL11AQ9H165 835 aa30.54■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 A0A1B0GUL6 1792 aa30.53■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa30.53■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 ERC1Q8IUD2 1116 aa30.52■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 KIF1BPQ96EK5 621 aa30.52■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 ANKRD2Q9GZV1 360 aa30.52■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 SNED1Q8TER0 1413 aa30.52■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 XDHP47989 1333 aa30.51■■■□□ 2.48
PQLC3-201ENST00000295083 MPNDQ8N594 471 aa30.51■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 LRRCC1Q9C099 1032 aa30.51■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 PODXL2Q9NZ53 605 aa30.51■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.5■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 POLLQ9UGP5 575 aa30.5■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa30.5■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 LTBP1Q14766 1721 aa30.5■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP30.5■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 CCDC93Q567U6 631 aa30.5■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa30.5■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 TIMM10P62072 90 aa30.48■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 TBC1D16Q8TBP0 767 aa30.48■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 DUOX1Q9NRD9 1551 aa30.47■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 UFL1O94874 794 aa30.47■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 FGFR2P21802 821 aa30.47■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 GGA1Q9UJY5 639 aa30.47■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 ZNF804BA4D1E1 1349 aa30.47■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 TNNI3KQ59H18 835 aa30.46■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 SOGA3Q5TF21 947 aa30.46■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 RTKN2Q8IZC4 609 aa30.46■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa30.46■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 KLRK1P26718 216 aa30.45■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 ATP2B3Q16720 1220 aa30.45■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 LEMD3Q9Y2U8 911 aa30.45■■■□□ 2.47
PQLC3-201ENST00000295083 A0A1B0GUL7 405 aa30.45■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 C6orf229H3BNL8 230 aa30.45■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 KCNJ4P48050 445 aa30.45■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 NUCB1Q02818 461 aa30.45■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 ATP2B4P23634 1241 aa30.44■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 UBE4AQ14139 1066 aa30.44■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 GPR108Q9NPR9 543 aa30.44■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa30.43■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 TXNRD3Q86VQ6 643 aa30.43■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 LNPKQ9C0E8 428 aa30.43■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 AKAP2Q9Y2D5 859 aa30.43■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 NFKBIEO00221 500 aa30.43■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 LPIN2Q92539 896 aa30.43■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 NEUROD6Q96NK8 337 aa30.43■■■□□ 2.46
PQLC3-201ENST00000295083 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms