RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272139.4

C1orf35-201, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf35, Length 1,427 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-201ENST00000272139 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.49■■■□□ 2.15
C1orf35-201ENST00000272139 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.48■■■□□ 2.15
C1orf35-201ENST00000272139 SBF1O95248 1867 aa28.47■■■□□ 2.15
C1orf35-201ENST00000272139 NEFLP07196 543 aa28.47■■■□□ 2.15
C1orf35-201ENST00000272139 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
C1orf35-201ENST00000272139 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.47■■■□□ 2.15
C1orf35-201ENST00000272139 SSH3Q8TE77 659 aa28.47■■■□□ 2.15
C1orf35-201ENST00000272139 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.47■■■□□ 2.15
C1orf35-201ENST00000272139 NFKBIEO00221 500 aa28.46■■■□□ 2.15
C1orf35-201ENST00000272139 HMMRO75330 724 aa28.45■■■□□ 2.15
C1orf35-201ENST00000272139 POLA2Q14181 598 aa28.45■■■□□ 2.15
C1orf35-201ENST00000272139 CCDC93Q567U6 631 aa28.44■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 OLFM4Q6UX06 510 aa28.44■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 COPRSQ9NQ92 184 aa28.44■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.44■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 SIL1Q9H173 461 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 FBXO3Q9UK99 471 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.42■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 EYA2O00167 538 aa28.42■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 SIRT2Q8IXJ6 389 aa28.42■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 LRRC24Q50LG9 513 aa28.41■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 SLC51AQ86UW1 340 aa28.41■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 MPNDQ8N594 471 aa28.41■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.41■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.41■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 ANKRD2Q9GZV1 360 aa28.4■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 CIAO1O76071 339 aa28.39■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 CHRNDQ07001 517 aa28.39■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
C1orf35-201ENST00000272139 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.38■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 PRELPP51888 382 aa28.38■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 GPSM2P81274 684 aa28.38■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.38■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 KIF3CO14782 793 aa28.37■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 XDHP47989 1333 aa28.37■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 METTL24Q5JXM2 366 aa28.36■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.36■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.36■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.35■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 A0A1B0GUL6 1792 aa28.35■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 TAF5LO75529 589 aa28.35■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 GGA1Q9UJY5 639 aa28.35■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 C6orf229H3BNL8 230 aa28.34■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.34■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 PSMD1Q99460 953 aa28.34■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.34■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.34■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 SNED1Q8TER0 1413 aa28.33■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 ATP2B4P23634 1241 aa28.33■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.33■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.33■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.33■■■□□ 2.13
C1orf35-201ENST00000272139 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 GLTPD2A6NH11 291 aa28.32■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 UFL1O94874 794 aa28.32■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 KCNJ4P48050 445 aa28.32■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.32■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 POLLQ9UGP5 575 aa28.32■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 LTBP1Q14766 1721 aa28.31■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 PDE8BO95263 885 aa28.31■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 TOMM70O94826 608 aa28.3■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.3■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.29■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.29■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.28■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 EYA3Q99504 573 aa28.28■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 DCTPP1Q9H773 170 aa28.28■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 SASH1O94885 1247 aa28.27■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 TFCP2Q12800 502 aa28.27■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 UBE4AQ14139 1066 aa28.27■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 WASHC4Q2M389 1173 aa28.27■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.27■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 SNAP23O00161 211 aa28.26■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 RAB11FIP3O75154 756 aa28.26■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 VPS33BQ9H267 617 aa28.26■■■□□ 2.12
C1orf35-201ENST00000272139 RRAGCQ9HB90 399 aa28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms