RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088356.9

Usf3-201, Transcript of Gene model 608, (NCBI), mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Usf3, Length 757 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3-201ENSMUST00000088356 Htra3Q9D236 459 aa22.33■■□□□ 1.17
Usf3-201ENSMUST00000088356 Stard3nlQ9DCI3 235 aa22.33■■□□□ 1.17
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ehd4Q9EQP2 541 aa22.33■■□□□ 1.17
Usf3-201ENSMUST00000088356 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sox10Q04888 466 aa22.32■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Large2Q5XPT3 690 aa22.32■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Terf1P70371 421 aa22.31■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sp8Q8BMJ8 486 aa22.31■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gimap3Q99MI6 301 aa22.31■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 EhhadhQ9DBM2 718 aa22.31■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sytl4Q9R0Q1 673 aa22.31■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Map2k1P31938 393 aa22.3■■□□□ 1.16
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Usf3-201ENSMUST00000088356 Slc14a2Q8R4T9 930 aa22.3■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Lman1lQ8VCD3 505 aa22.3■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Atxn3Q9CVD2 355 aa22.3■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Col11a1Q61245 1804 aa22.29■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Kifc2O08672 792 aa22.29■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 IntuQ059U7 942 aa22.29■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Akap4Q60662 849 aa22.29■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rtp1Q8C8C1 263 aa22.29■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Mageb2A2AHM0 380 aa22.28■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Irf6P97431 467 aa22.28■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa22.28■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 RragcQ99K70 398 aa22.28■■□□□ 1.16
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Usf3-201ENSMUST00000088356 Scn10aQ6QIY3 1958 aa22.28■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 1700029H14RikE9PY36 240 aa22.27■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Acsl1P41216 699 aa22.27■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa22.27■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Uspl1Q3ULM6 1089 aa22.27■■□□□ 1.16
Usf3-201ENSMUST00000088356 Exoc6bA6H5Z3 810 aa22.26■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa22.26■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pde4aO89084 844 aa22.25■■□□□ 1.15
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Usf3-201ENSMUST00000088356 Csrnp1P59054 583 aa22.25■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Itga6Q61739 1091 aa22.25■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Usp17lbE9Q9U0 468 aa22.24■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Il15P48346 162 aa22.24■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Echdc1Q9D9V3 322 aa22.24■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Brca1P48754 1812 aa22.24■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ldlrad1D3YYZ1 218 aa22.23■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Wnt10bP48614 389 aa22.23■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Q3UK37 420 aa22.23■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 LdhdQ7TNG8 484 aa22.23■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Epc2Q8C0I4 808 aa22.23■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ube4aE9Q735 1028 aa22.22■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ly6dP35459 127 aa22.22■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Znf496Q5SXI5 585 aa22.22■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Secisbp2lQ6A098 1086 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ripor2Q80U16 1078 aa22.22■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Kbtbd13Q8C828 458 aa22.22■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Trpv1Q704Y3 839 aa22.21■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Mxd3Q80US8 206 aa22.21■■□□□ 1.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa22.2■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Znf18Q810A1 556 aa22.2■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Exoc6Q8R313 802 aa22.2■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tmem79Q9D709 391 aa22.2■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa22.19■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Glrx3Q9CQM9 337 aa22.19■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 MsraQ9D6Y7 233 aa22.19■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cntnap3E9PY62 1287 aa22.18■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Prkg1P0C605 671 aa22.18■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 B230104I21RikQ3USW4 141 aa22.18■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Clul1Q3ZRW6 464 aa22.18■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Bcs1lQ9CZP5 418 aa22.18■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa22.18■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Zbtb12Q9Z150 459 aa22.18■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ccdc51Q3URS9 406 aa22.17■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ofd1Q80Z25 1017 aa22.17■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gpr37l1Q99JG2 481 aa22.17■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ankrd50F7BE84 1390 aa22.16■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 MycnP03966 462 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 WdpcpQ8C456 722 aa22.15■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Hdac9Q99N13 588 aa22.15■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa22.15■■□□□ 1.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Serpinb2P12388 415 aa22.14■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Mmp14P53690 582 aa22.14■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Grm1P97772 1199 aa22.14■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Trmt1Q3TX08 663 aa22.14■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 EspnlQ3UYR4 1005 aa22.14■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 H2-Q4Q8HWB2 354 aa22.14■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tgm5Q9D7I9 724 aa22.14■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Dclk1Q9JLM8 756 aa22.14■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 B3galt4Q9Z0F0 371 aa22.14■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 S1pr4Q9Z0L1 386 aa22.14■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fgl2P12804 432 aa22.13■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Zscan21Q07231 555 aa22.13■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nell2Q61220 819 aa22.13■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa22.12■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Map3k13Q1HKZ5 959 aa22.12■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Spryd7Q3TFQ1 196 aa22.12■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fchsd1Q6PFY1 688 aa22.12■■□□□ 1.13
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