RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prkar2bP31324 416 aa28.34■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Csrnp1P59054 583 aa28.34■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 VgfQ0VGU4 617 aa28.34■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim58Q5NCC9 485 aa28.34■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NynrinQ5DTZ0 1840 aa28.34■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pank1Q8K4K6 548 aa28.33■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Osbpl5Q9ER64 874 aa28.33■■■□□ 2.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ecm29Q6PDI5 1840 aa28.32■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eya2O08575 532 aa28.32■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psmd14O35593 310 aa28.32■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AaasP58742 546 aa28.32■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 L3mbtl2P59178 703 aa28.32■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pappa2E9PZ87 1789 aa28.32■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Casp1P29452 402 aa28.31■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GmpsQ3THK7 693 aa28.31■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa28.31■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NinQ61043 2035 aa28.3■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cfap44E9Q5M6 1843 aa28.3■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sult6b1P0CC03 303 aa28.3■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Terf1P70371 421 aa28.3■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SobpQ0P5V2 864 aa28.3■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc51Q3URS9 406 aa28.3■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa28.3■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PdgfdQ925I7 370 aa28.3■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnq5Q9JK45 933 aa28.3■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trpm7Q923J1 1863 aa28.29■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp8a2P98200 1148 aa28.29■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm2163Q6PCY5 473 aa28.29■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zkscan8Q8BSL0 588 aa28.29■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxo3Q9DC63 480 aa28.29■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rps12P63323 132 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plekhf1Q3TB82 279 aa28.28■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa28.28■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa28.28■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ciao1Q99KN2 339 aa28.28■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Glrx3Q9CQM9 337 aa28.28■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LratQ9JI60 231 aa28.28■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pde8bE9Q4S1 865 aa28.27■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp17lbE9Q9U0 468 aa28.27■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ier5O89113 308 aa28.27■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NyxP83503 476 aa28.27■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dhx38Q80X98 1228 aa28.27■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa28.27■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ParvgQ9ERD8 331 aa28.27■■■□□ 2.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fchsd1Q6PFY1 688 aa28.26■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf18Q810A1 556 aa28.26■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psme4Q5SSW2 1843 aa28.25■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scn11aQ9R053 1765 aa28.25■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 UtrnE9Q6R7 3430 aa28.25■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ptrh1Q8BW00 204 aa28.25■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Speer4dL7N216 212 aa28.24■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kifc2O08672 792 aa28.24■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cwc27Q3TKY6 469 aa28.24■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atg9aQ68FE2 551 aa28.24■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DaglaQ6WQJ1 1044 aa28.24■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Triml2E9PW10 424 aa28.23■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nell2Q61220 819 aa28.22■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem67Q8BR76 992 aa28.22■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa28.22■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa28.21■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rhbdl3P58873 404 aa28.21■■■□□ 2.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp8b2P98199 1209 aa28.2■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cnot7Q60809 285 aa28.19■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scaf8Q6DID3 1268 aa28.19■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa28.18■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Angel2Q8K1C0 544 aa28.18■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmc2Q8R4P4 888 aa28.18■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EspnlQ3UYR4 1005 aa28.17■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Srgap3Q812A2 1099 aa28.17■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa28.17■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kiaa0753Q6A000 959 aa28.16■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Polr3dQ91WD1 398 aa28.16■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ascc2Q91WR3 749 aa28.16■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa28.16■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Large2Q5XPT3 690 aa28.15■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm4340L7N2C4 268 aa28.14■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp2b3Q0VF55 1220 aa28.14■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Agtpbp1Q641K1 1218 aa28.14■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trmt44Q9D2Q2 713 aa28.14■■■□□ 2.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 D1Pas1P16381 660 aa28.13■■■□□ 2.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mmp14P53690 582 aa28.13■■■□□ 2.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fzd9Q9R216 592 aa28.13■■■□□ 2.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ifi207E9Q3L4 978 aa28.12■■■□□ 2.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ets1P27577 440 aa28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.2 ms