RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592911.5

SMAD4-215, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-215ENST00000592911 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 DUX5Q96PT3 197 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 WACQ9BTA9 647 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 NANOGQ9H9S0 305 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 MMP26Q9NRE1 261 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 A0A1B0GWA3 101 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 PLPP3O14495 311 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 RFXANKO14593 260 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 DHHO43323 396 aa7.31□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 BGLAPP02818 100 aa7.31□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 MAKP20794 623 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF84P51523 738 aa7.31□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 DSTNP60981 165 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 PAX2Q02962 417 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 HIST3H3Q16695 136 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ARL9Q6T311 187 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF621Q6ZSS3 439 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 OR5J2Q8NH18 312 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 OR52E6Q96RD3 313 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ZBTB18Q99592 522 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SEPHS2Q99611 448 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.31□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 C1RLQ9NZP8 487 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 IL19Q9UHD0 177 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 HAO1Q9UJM8 370 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.31□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 PIN1P1O15428 100 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 HPRP00739 348 aa7.3□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 BCHEP06276 602 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 BPGMP07738 259 aa7.3□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 PGA3P0DJD8 388 aa7.3□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 STOMP27105 288 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 CD80P33681 288 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 ARHGDIAP52565 204 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 AQP5P55064 265 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 PROK1P58294 105 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 NCALDP61601 193 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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SMAD4-215ENST00000592911 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 MTX3Q5HYI7 312 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 C10orf128Q5T292 105 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 GPR157Q5UAW9 335 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 CARD17Q5XLA6 110 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 FNDC8Q8TC99 324 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 AGR3Q8TD06 166 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-215ENST00000592911 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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