RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 HSPB11Q9Y547 144 aa4.36□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 MYO16Q9Y6X6 1858 aa4.36□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 MSGN1A6NI15 193 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 MPTX1A8MV57 137 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 LOC730098B7Z3J9 87 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 CCL22O00626 93 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 CXCL11O14625 94 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 CTDSPLO15194 276 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 FABP7O15540 132 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 SLC19A2O60779 497 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 TBX19O60806 448 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 STK16O75716 305 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 B3GALNT1O75752 331 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 DIRAS1O95057 198 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 CDRT1O95170 752 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 CLDN9O95484 217 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 ASMTP46597 345 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 ATP12AP54707 1039 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 HMGCS1Q01581 520 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 WSCD2Q2TBF2 565 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 KLHL12Q53G59 568 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 ARMC12Q5T9G4 340 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 NOXRED1Q6NXP6 359 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 BHLHB9Q6PI77 547 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 UNC5DQ6UXZ4 953 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 OR2T4Q8NH00 348 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 OMA1Q96E52 524 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.35□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 DUX3Q96PT4 197 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa4.35□□□□□ -1.71
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TRDN-204ENST00000542443 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 H0YIV9 168 aa4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 GFYI3L273 518 aa4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 I3L521 148 aa4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 TLR4O00206 839 aa4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 FAAHO00519 579 aa4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 FPGTO14772 594 aa4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 ZNF749O43361 778 aa4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 KDELR3O43731 214 aa4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 PRAF2O60831 178 aa4.34□□□□□ -1.71
TRDN-204ENST00000542443 FCGR3BO75015 233 aa4.34□□□□□ -1.71
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