RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 NOTCH2Q04721 2471 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 INS-IGF2F8WCM5 200 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 BET1O15155 118 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 RP2O75695 350 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRP72O76094 671 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTDNEP1O95476 244 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 AIFM1O95831 613 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 AQP2P41181 271 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 NSG1P42857 185 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 ESRRGP62508 458 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 CNTNAP1P78357 1384 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 ECH1Q13011 328 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 MOBPQ13875 183 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 LY6G6FQ5SQ64 297 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCNJQ5T5M9 372 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 SASS6Q6UVJ0 657 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM107Q6UX40 140 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 CERS6Q6ZMG9 384 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 BIVMQ86UB2 503 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC22A9Q8IVM8 553 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 LIX1Q8N485 282 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPATA4Q8NEY3 305 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR10J6PQ8NGY7 276 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 CXorf40AQ8TE69 158 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM3DQ96BQ1 224 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF681Q96N22 645 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP5SQ99766 215 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPIN2AQ99865 258 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDFIP1Q9BT67 221 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCRT1Q9BWW7 348 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 HPCAL4Q9UM19 191 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 CIB4A0PJX0 185 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM150BA6NC51 233 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 EEDO75530 441 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLPXO76031 633 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLIC3O95833 236 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSPAN13O95857 204 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 BCHEP06276 602 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGHV1-8P0DP01 117 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF250P15622 560 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSMC3P17980 439 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXN2P32314 431 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 CEACAM6P40199 344 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 NAMPTP43490 491 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 CSNK1A1P48729 337 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF138P52744 262 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 MXD1Q05195 221 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 TWF1Q12792 350 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCP10Q12799 353 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERCC8Q13216 396 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAJC24Q6P3W2 148 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM228AQ86W67 206 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBALD2Q8IYN6 164 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDIK1LQ8N165 341 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 EID2Q8N6I1 236 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR7G2Q8NG99 324 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR2L8Q8NGY9 312 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNG3Q8TAE7 436 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACMSDQ8TDX5 336 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEH1LQ96EE3 360 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 PKNOX2Q96KN3 472 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 SERPINB12Q96P63 405 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR51M1Q9H341 326 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ING4Q9UNL4 249 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPRTO14522 1441 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PP18 115 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 HEATR9A2RTY3 570 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF716A6NP11 495 aa1.51□□□□□ -2.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCP11X1B4DZS4 312 aa1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms