RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVS71-1P61550 626 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAPTM4AQ15012 233 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM154Q6P9G4 183 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLCCI1Q86VQ1 547 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFLNBQ8N5W9 214 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ICA1LQ8NDH6 482 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMURF2Q9HAU4 748 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC100653049A0A140TA62 436 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM220BPB1ANY3 271 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT34O76011 436 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFP02787 698 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDAP32320 146 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCGF3Q3KNV8 242 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RINLQ6ZS11 566 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPD52L3Q96J77 140 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPAN32Q96QS1 320 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TXNIPQ9H3M7 391 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANK2Q01484 3957 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RP2O75695 350 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NR2C1P13056 603 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD47Q08722 323 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ST3GAL3Q11203 375 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALG10Q5BKT4 473 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2T12Q8NG77 320 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TREM2Q9NZC2 230 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIF3AQ9Y2N7 669 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT9BO14905 357 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCF21O43680 179 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIP5K1CO60331 668 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNOP22674 350 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFNA8P32881 189 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL8P80075 99 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FMODQ06828 376 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGCAQ16586 387 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOGQ16653 247 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1J1Q8NGS3 322 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSMAFQ92636 917 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NABP1Q96AH0 204 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BPIFA2Q96DR5 249 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRRC1Q96M27 445 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTR3EA5X5Y0 456 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GMNCA6NCL1 334 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM157AC9JC47 383 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC14BO60729 498 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MT-ND5P03915 603 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFI30P13284 250 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF32P17041 273 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DRD4P21917 467 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STOMP27105 288 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SELENOWP63302 87 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF11Q15544 211 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CGB2Q6NT52 195 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MICU2Q8IYU8 434 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM186Q96B77 213 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LPAR2Q9HBW0 351 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIF1ANQ9NWT6 349 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A4GNTQ9UNA3 340 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELOVL7A1L3X0 281 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSMBP08118 114 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAAP10253 952 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LZICQ8WZA0 190 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBP7Q96R05 134 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALG12Q9BV10 488 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV3-13P01766 116 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL27P61353 136 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMO4P61968 165 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEKQ02763 1124 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLO1Q04760 184 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR51F2Q8NH61 342 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POM121L2Q96KW2 1035 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DECR2Q9NUI1 292 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METRNQ9UJH8 293 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C5orf49A4QMS7 147 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHMP01871 453 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRYBB2P43320 205 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GDI2P50395 445 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVK-25P63136 954 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THEM4Q5T1C6 240 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM27BQ5VT28 67 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKR7LQ8NHP1 331 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FNDC8Q8TC99 324 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RCN3Q96D15 328 aa22.33■■□□□ 1.17
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