RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 SIAH2O43255 324 aa16.09■□□□□ 0.17
PTX4-201ENST00000293922 PRKYO43930 277 aa16.09■□□□□ 0.17
PTX4-201ENST00000293922 IFNGP01579 166 aa16.09■□□□□ 0.17
PTX4-201ENST00000293922 ISL1P61371 349 aa16.09■□□□□ 0.17
PTX4-201ENST00000293922 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
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PTX4-201ENST00000293922 MESTQ5EB52 335 aa16.09■□□□□ 0.17
PTX4-201ENST00000293922 HDDC2Q7Z4H3 204 aa16.09■□□□□ 0.17
PTX4-201ENST00000293922 ADCK1Q86TW2 530 aa16.09■□□□□ 0.17
PTX4-201ENST00000293922 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.09■□□□□ 0.17
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PTX4-201ENST00000293922 MED18Q9BUE0 208 aa16.09■□□□□ 0.17
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PTX4-201ENST00000293922 A6NIZ1 184 aa16.08■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 MPZL2O60487 215 aa16.08■□□□□ 0.16
PTX4-201ENST00000293922 SLC2A10O95528 541 aa16.08■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 ACVR1BP36896 505 aa16.08■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 RAP1BP61224 184 aa16.08■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 FN3KQ9H479 309 aa16.08■□□□□ 0.16
PTX4-201ENST00000293922 C12orf49Q9H741 205 aa16.08■□□□□ 0.16
PTX4-201ENST00000293922 ZFHX3Q15911 3703 aa16.08■□□□□ 0.16
PTX4-201ENST00000293922 SLC35F4A4IF30 521 aa16.07■□□□□ 0.16
PTX4-201ENST00000293922 CENPBD1B2RD01 187 aa16.07■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF432O94892 652 aa16.07■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 SLC25A30Q5SVS4 291 aa16.07■□□□□ 0.16
PTX4-201ENST00000293922 STAC2Q6ZMT1 411 aa16.07■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 NPEPL1Q8NDH3 523 aa16.07■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 KCNK17Q96T54 332 aa16.07■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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PTX4-201ENST00000293922 OR2M2Q96R28 347 aa16.06■□□□□ 0.16
PTX4-201ENST00000293922 NMNAT3Q96T66 252 aa16.06■□□□□ 0.16
PTX4-201ENST00000293922 ALG12Q9BV10 488 aa16.06■□□□□ 0.16
PTX4-201ENST00000293922 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PTX4-201ENST00000293922 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTX4-201ENST00000293922 ZNF726A6NNF4 738 aa16.05■□□□□ 0.16
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