RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 SRPK3Q9UPE1 567 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 RUNX2Q13950 521 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 FAM57BQ71RH2 274 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 AMER3Q8N944 861 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF709Q8N972 641 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 PFDN5Q99471 154 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 OR52A1Q9UKL2 312 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 BRINP1O60477 761 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 SYNGR4O95473 234 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 M6PRP20645 277 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 BCORP1Q8N888 145 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 ANGPTL6Q8NI99 470 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 UPRTQ96BW1 309 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 DERL3Q96Q80 235 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 SPIN2AQ99865 258 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 OR10A2Q9H208 303 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MCCC2Q9HCC0 563 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 ANKRD61A6NGH8 418 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 SNRPGP15A8MWD9 76 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 FFAR1O14842 300 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 RGS13O14921 159 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 IFNA1P01562 189 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 RAB6AP20340 208 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 S100A12P80511 92 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 PEA15Q15121 130 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 NLRC3Q7RTR2 1065 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 RNF141Q8WVD5 230 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MIB2Q96AX9 1013 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 CD207Q9UJ71 328 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 TNFRSF10CO14798 259 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 IFNA17P01571 189 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 EMDP50402 254 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MALLQ13021 153 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 STAC2Q6ZMT1 411 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 BEND4Q6ZU67 534 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MAP3K3Q99759 626 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 LRIT1Q9P2V4 623 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 LINC01553A4QN01 128 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 PMPCAQ10713 525 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF695Q8IW36 515 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 CA13Q8N1Q1 262 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MRGPRX3Q96LB0 322 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 H0Y8X5 98 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 FBXO24O75426 580 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MT-ATP6P00846 226 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 DOC2BQ14184 412 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 CDKN3Q16667 212 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 P4HA3Q7Z4N8 544 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 KCNG3Q8TAE7 436 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 FGGYQ96C11 551 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MARVELD1Q9BSK0 173 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 VN1R3Q9BXE9 311 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 CA14Q9ULX7 337 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 WASF3Q9UPY6 502 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 OR5K3A6NET4 321 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 POM121BA6NF01 834 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 GJE1A6NN92 205 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 PRAMEF4O60810 478 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 CEACAM5P06731 702 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 THBS2P35442 1172 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 EMC4Q5J8M3 183 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 RNLSQ5VYX0 342 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MARCH3Q86UD3 253 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 NINJ1Q92982 152 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MMACHCQ9Y4U1 282 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 STK17BO94768 372 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 RPL27P61353 136 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 AANATQ16613 207 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MPEG1Q2M385 716 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 SLC37A2Q8TED4 501 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 ORAI1Q96D31 301 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 LRRC46Q96FV0 321 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 HHIPQ96QV1 700 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 SCPEP1Q9HB40 452 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 A8MVM7 634 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 SCO1O75880 301 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 HSD17B7P56937 341 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 MISPQ8IVT2 679 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 OR2L13Q8N349 312 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRU-202ENST00000373779 OR13H1Q8NG92 308 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms