RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 TSPAN12O95859 305 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 SOD1P00441 154 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 ERVK-10P10266 1014 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 TPSB2P20231 275 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 LAP3P28838 519 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 CA7P43166 264 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 CCT3P49368 545 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 CSNK2BP67870 215 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 TPSAB1Q15661 275 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 GTDC1Q4AE62 458 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 C16orf82Q7Z2V1 217 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 KIAA1328Q86T90 577 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 NT5DC3Q86UY8 548 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 PAQR7Q86WK9 346 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 NPWQ8N729 165 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 STPG4Q8N801 248 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 POC1AQ8NBT0 407 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 STXBP6Q8NFX7 210 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 OR9Q2Q8NGE9 314 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 OR5AP2Q8NGF4 316 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 NANPQ8TBE9 248 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 SLC22A8Q8TCC7 542 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 PIH1D2Q8WWB5 315 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 AMDHD1Q96NU7 426 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 CHRDL1Q9BU40 450 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 RHOJQ9H4E5 214 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 CHMP5Q9NZZ3 219 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 ONECUT1Q9UBC0 465 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 IFT52Q9Y366 437 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 F8P00451 2351 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 SNTNA6NMZ2 147 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 USP27XA6NNY8 438 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 WRBO00258 174 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 ALOX12BO75342 701 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 POP7O75817 140 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 LCA5LO95447 670 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 CLPTM1O96005 669 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 HSMCR30P0CW71 290 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 KLK2P20151 261 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 TBXA2RP21731 343 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 PCMT1P22061 227 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 MMP11P24347 488 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 MIPP30301 263 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 CA5AP35218 305 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 RORAP35398 523 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 SPAM1P38567 509 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 ID1P41134 155 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 NSG1P42857 185 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 MAGEA5P43359 124 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 MAGEA8P43361 318 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 HCAR3P49019 387 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 GSCP56915 257 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 SEC61GP60059 68 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 KRTAP10-11P60412 298 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 DEFB110Q30KQ9 67 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 CTSL3PQ5NE16 218 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 NEPROQ6NW34 567 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 BHLHB9Q6PI77 547 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 TMEM220Q6QAJ8 160 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 CERS6Q6ZMG9 384 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 SH2D5Q6ZV89 423 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 RAB42Q8N4Z0 105 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 SPATA4Q8NEY3 305 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 OR6S1Q8NH40 331 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 LHX4Q969G2 390 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 LYSMD1Q96S90 227 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 C19orf43Q9BQ61 176 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 HOXD1Q9GZZ0 328 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 COMMD4Q9H0A8 199 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 Q9HAA7 133 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 RAB18Q9NP72 206 aa4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCL20-201ENST00000358813 NTNG1Q9Y2I2 539 aa4.63□□□□□ -1.67
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