RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404377.3

TNFSF18-201, Transcript of TNF superfamily member 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF18, Length 2,008 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18-201ENST00000404377 TXNDC8Q6A555 127 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 ZNF621Q6ZSS3 439 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 ZNF720Q7Z2F6 126 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 DTX1Q86Y01 620 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 UEVLDQ8IX04 471 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 C11orf42Q8N5U0 333 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 OR9Q2Q8NGE9 314 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 SLC35B2Q8TB61 432 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 COQ8BQ96D53 544 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 P2RY11Q96G91 374 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 SCMH1Q96GD3 660 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 REEP6Q96HR9 211 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 OR5B12Q96R08 314 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 TMEM121Q9BTD3 319 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 DPH1Q9BZG8 443 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 MMP28Q9H239 520 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 KCNK15Q9H427 330 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 FAM96AQ9H5X1 160 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 ELOVL3Q9HB03 270 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 TMEM27Q9HBJ8 222 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 PSG8Q9UQ74 426 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 TAF6LQ9Y6J9 622 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 V9GYS6 101 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 GRIN2AQ12879 1464 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 A0A1W2PR77 199 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 PSMB11A5LHX3 300 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 CDHR4A6H8M9 788 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 C21orf140B9A014 251 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 AIREO43918 545 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 MT-ND4P03905 459 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 CYBBP04839 570 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 NME2P22392 152 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 HRH2P25021 359 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 MST1P26927 711 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 APLNRP35414 380 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 SLC6A8P48029 635 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 CAV2P51636 162 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 OR2B8PP59922 312 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 CAV1Q03135 178 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 MALLQ13021 153 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 CTBP1Q13363 440 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 TUSC3Q13454 348 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 CARD16Q5EG05 197 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 PIGZQ86VD9 579 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 SYT12Q8IV01 421 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 SVBPQ8N300 66 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 YIPF7Q8N8F6 280 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 OR5M9Q8NGP3 310 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 CASTOR1Q8WTX7 329 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 ROPN1LQ96C74 230 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 MRAP2Q96G30 205 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 KLHDC7BQ96G42 594 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 OR2A14Q96R47 310 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 FCRL5Q96RD9 977 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 PLEKHF1Q96S99 279 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 TRIM51Q9BSJ1 452 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 SPATC1LQ9H0A9 340 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 ABCG5Q9H222 651 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 GCM1Q9NP62 436 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 FBXL12Q9NXK8 326 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 CBLCQ9ULV8 474 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 GPR132Q9UNW8 380 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 TFR2Q9UP52 801 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 WDR45Q9Y484 360 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa4.89□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 SSH2Q76I76 1423 aa4.88□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 NSD3Q9BZ95 1437 aa4.88□□□□□ -1.63
TNFSF18-201ENST00000404377 CROCCQ5TZA2 2017 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.3 ms