RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 CASP12Q6UXS9 341 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 UEVLDQ8IX04 471 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 OR51A7Q8NH64 312 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 CYGBQ8WWM9 190 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 ADGRG7Q96K78 797 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 TIMP4Q99727 224 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SLC29A1Q99808 456 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 IFT27Q9BW83 186 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 INIPQ9NRY2 104 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 IL20Q9NYY1 176 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 EMC3Q9P0I2 261 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 RAB26Q9ULW5 256 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 ITPR1Q14643 2758 aa8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0J9YW62 118 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GTH9 108 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SLC22A20A6NK97 555 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 RIIAD1A6NNX1 92 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 LRRN3E7EW58 273 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 XKRYO14609 159 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 PRRG2O14669 202 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 IDH3BO43837 385 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 EFNA2O43921 213 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 CXCL13O43927 109 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 MPZL2O60487 215 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 AKR7A3O95154 331 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SNAP29O95721 258 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 HPXP02790 462 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 OPN1LWP04000 364 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 HMGN1P05114 100 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF3P17036 446 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF43P17038 809 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 PAICSP22234 425 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 PTGS2P35354 604 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 TDGF1P3P51864 188 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 CRISP1P54107 249 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 CASP6P55212 293 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 CLDN15P56746 228 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 LY6DQ14210 128 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 PGGHGQ32M88 737 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 EMC4Q5J8M3 183 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM225Q6GV28 225 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 PXKQ7Z7A4 578 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 GPAT4Q86UL3 456 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 Q8N1Y9 231 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 GPA33Q99795 319 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 CDIP1Q9H305 208 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 MCCC2Q9HCC0 563 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 FANCFQ9NPI8 374 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 USP24Q9UPU5 2620 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 A6NIZ1 184 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SNTNA6NMZ2 147 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 ZAR1LA6NP61 321 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 CLCA1A8K7I4 914 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 AHRRA9YTQ3 701 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 C11orf98E9PRG8 122 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 PLPP3O14495 311 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 GPR171O14626 319 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 IMPA2O14732 288 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SLC16A6O15403 523 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 IGHMP01871 453 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 TPOP07202 933 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 CD14P08571 375 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 TSPAN19P0C672 248 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-211ENST00000497210 SDHAP31040 664 aa8.66□□□□□ -1.02
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