RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TMEM123	Q8N131	208 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MUCL1	Q96DR8	90 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ASB9	Q96DX5	294 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PYURF	Q96I23	114 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	C7orf34	Q96L11	122 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	UPB1	Q9UBR1	384 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NOTCH2	Q04721	2471 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	FFAR1	O14842	300 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	KLF4	O43474	513 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ENTPD5	O75356	428 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	LYZL6	O75951	148 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	OR7A10	O76100	309 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	OR6A2	O95222	327 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	CH25H	O95992	272 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	HPR	P00739	348 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	HIST1H2AB	P04908	130 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ADORA3	P0DMS8	318 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NCK1	P16333	377 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	HOXC12	P31275	282 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MAGEA2	P43356	314 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SELENOP	P49908	381 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	CLDN17	P56750	224 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SMIM11A	P58511	58 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PRKCD	Q05655	676 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	FAP	Q12884	760 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	GK3P	Q14409	553 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PPA1	Q15181	289 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	GABRA6	Q16445	453 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NRN1L	Q496H8	165 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NIPAL3	Q6P499	406 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	CDH24	Q86UP0	819 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	CDC20B	Q86Y33	519 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	P3H2	Q8IVL5	708 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	RNF148	Q8N7C7	305 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	OR6X1	Q8NH79	312 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MBD6	Q96DN6	1003 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SGTB	Q96EQ0	304 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	RADIL	Q96JH8	1075 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	OR2M2	Q96R28	347 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ZNF347	Q96SE7	839 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	SEPHS2	Q99611	448 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PIP5K1A	Q99755	562 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128		A0A087WUU8	490 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	CIB4	A0PJX0	185 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	LRRN3	E7EW58	273 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	MGRN1	O60291	552 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	RAD51D	O75771	328 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	ATP5H	O75947	161 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	KRT33A	O76009	404 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP34-208	ENST00000467128	IGHV3-9	P01782	118 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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