RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592186.5

SMAD4-214, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 1,306 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-214ENST00000592186 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 TINAGQ9UJW2 476 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 MEMO1Q9Y316 297 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 EMC9Q9Y3B6 208 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.51□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 ATRXP46100 2492 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 A6NIZ1 184 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 ZNF726A6NNF4 738 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 CENPBD1B2RD01 187 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 C11orf98E9PRG8 122 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 CCL21O00585 134 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SOCS2O14508 198 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 ARPC3O15145 178 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 IL18BPO95998 194 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 BCL10O95999 233 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 HMGN1P05114 100 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 CTSSP25774 331 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 PEX2P28328 305 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 OPRM1P35372 400 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 CRISP1P54107 249 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 CTXN1P60606 82 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 RAP1BP61224 184 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 RAP1AP62834 184 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 IGFBP7Q16270 282 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 LPCAT4Q643R3 524 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SLC27A4Q6P1M0 643 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 KDM8Q8N371 416 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 LRRC75AQ8NAA5 344 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 OR2T33Q8NG76 320 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 MOSPD2Q8NHP6 518 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 FNDC8Q8TC99 324 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 ABHD3Q8WU67 409 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 RND1Q92730 232 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 TMEM45BQ96B21 275 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SAMD8Q96LT4 415 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SLC29A1Q99808 456 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 IFT27Q9BW83 186 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 TSSK6Q9BXA6 273 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 TXNIPQ9H3M7 391 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 NRIP3Q9NQ35 241 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 RCE1Q9Y256 329 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 XKRYO14609 159 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 TXNDC12O95881 172 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 IGHMP01871 453 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 F13BP05160 661 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 NR2C1P13056 603 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 IFNGR1P15260 489 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 POU1F1P28069 291 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 NOS3P29474 1203 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SDHAP31040 664 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SMSP52788 366 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 RPL27P61353 136 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 CDK5Q00535 292 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 NPRL3Q12980 569 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 ACKR1Q16570 336 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SLC36A3Q495N2 470 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 C4orf17Q53FE4 359 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 AAED1Q7RTV5 226 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 KIF18BQ86Y91 864 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 LNX2Q8N448 690 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 OR6K3Q8NGY3 331 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 OR6X1Q8NH79 312 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 PRR7Q8TB68 274 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 LRR1Q96L50 414 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-214ENST00000592186 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms