RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-209	ENST00000511467	AQP8	O94778	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	SNAPIN	O95295	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	PIRT	P0C851	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	IVD	P26440	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	DCTD	P32321	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ACVRL1	P37023	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	UFM1	P61960	85 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	PGGHG	Q32M88	737 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	KCT2	Q8NC54	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	TISP43	B9A030	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	LGI1	O95970	557 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	APOA2	P02652	100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ATP1B1	P05026	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	HNF4G	Q14541	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467		Q499Y3	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467		A0A1W2PQD3	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	TSC22D2	O75157	780 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	UPK1B	O75841	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	MT-CO1	P00395	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CSF2	P04141	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ITGB1	P05556	798 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	GJA4	P35212	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	SHC2	P98077	582 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	UGT8	Q16880	541 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	MED30	Q96HR3	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ATP5S	Q99766	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	TNFRSF10A	O00220	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	RRAS	P10301	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	CD81	P60033	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	MED25	Q71SY5	747 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN13-209	ENST00000511467	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms