RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q6ZSV7	163 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCL17	Q92583	94 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	C20orf173	Q96LM9	149 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR7D2	Q96RA2	312 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	STAC	Q99469	402 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	HHATL	Q9HCP6	504 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	LIPT2	A6NK58	231 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	AQP7P3	A6NL99	342 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLDN25	C9JDP6	229 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNPH1	O43598	174 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIP5K1C	O60331	668 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF432	O94892	652 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPP1R3D	O95685	299 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OPN1MW	P04001	364 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CRYBA1	P05813	215 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	MELTF	P08582	738 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CD79A	P11912	226 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAC2	P15153	192 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	HOXA5	P20719	270 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TACR3	P29371	465 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARR3	P36575	388 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLDN17	P56750	224 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	COL10A1	Q03692	680 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB39A	Q14964	217 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	RASA2	Q15283	850 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF141	Q15928	474 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TEX35	Q5T0J7	233 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLC3	Q6P597	504 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q6YL49	198 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYS1	Q717R9	158 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRINA	Q7Z429	371 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	REC114	Q7Z4M0	266 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35F6	Q8N357	371 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM234	Q8WY98	164 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SGCD	Q92629	289 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PHF21A	Q96BD5	680 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF382	Q96SR6	550 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	C5orf63	A6NC05	138 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPIAL4D	F5H284	164 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR137B	O60478	399 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOXH1	O75593	365 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBOX5	O94941	541 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHM	P01871	453 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBP1	P09455	135 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SBK2	P0C263	348 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	LAMP1	P11279	417 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SDC1	P18827	310 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAGEA12	P43365	314 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	MTNR1A	P48039	350 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC6A9	P48067	706 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GIPR	P48546	466 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	FUT5	Q11128	374 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2T11	Q8NH01	316 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ST7L	Q8TDW4	575 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB1C	Q92928	201 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARL8A	Q96BM9	186 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPCDC	Q96CD2	204 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	REEP4	Q9H6H4	257 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		7.22	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.5 ms