RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM72	A0PK05	275 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PIP5K1B	O14986	540 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX11A	O75192	247 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR7A3	O95154	331 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	AGR2	O95994	175 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PNP	P00491	289 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GPI	P06744	558 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCRB	P14927	111 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJB13	P59910	316 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	H3F3A	P84243	136 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	HGFAC	Q04756	655 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM7	Q14002	265 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	DAG1	Q14118	895 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGR1	Q14914	329 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	OR7A5	Q15622	319 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PGS1	Q32NB8	556 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC153	Q494R4	210 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT80	Q6KB66	452 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	NIPAL3	Q6P499	406 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	EMB	Q6PCB8	327 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM99	Q8N816	258 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf50	Q9BV19	199 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CRLF2	Q9HC73	371 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R233	179 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF208	O43345	1280 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CELA3B	P08861	270 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	OR12D1	P0DN82	309 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GAA	P10253	952 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CPA3	P15088	417 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ANPEP	P15144	967 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TACR3	P29371	465 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CCT5	P48643	541 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SELENOP	P49908	381 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	HBA1	P69905	142 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ10	P78508	379 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXL1	Q12952	345 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK14	Q16539	360 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MIDN	Q504T8	468 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GPAT3	Q53EU6	434 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	REP15	Q6BDI9	236 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	RDH5	Q92781	318 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC6A7	Q99884	636 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP26	Q9BV47	211 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF747	Q9BV97	191 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51I1	Q9H343	314 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	EMCN	Q9ULC0	261 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0G2JK05	382 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0G2JMP0	313 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0X1KG70	313 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN24	A6NM45	220 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	AP3D1	O14617	1153 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNGR3	O43761	229 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV1-44	P01699	117 aa		9.31	□□□□□ -0.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms