RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USF1P22415 310 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AQP5P55064 265 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCARB2Q14108 478 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM91A1Q658Y4 838 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIK3C3Q8NEB9 887 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF217Q8TC41 542 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC47A1Q96FL8 570 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SORCS2Q96PQ0 1159 aa22.77■■□□□ 1.24
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SELENONQ9NZV5 590 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL14Q9P2G3 628 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CORO2BQ9UQ03 480 aa22.77■■□□□ 1.24
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B9A039 149 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBLP22681 906 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC6A2P23975 617 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDLIM4P50479 330 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGKQ53H12 422 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYB5R2Q6BCY4 276 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VHLLQ6RSH7 139 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4F15Q8NGB8 312 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF607Q96SK3 696 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNK17Q96T54 332 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IKZF5Q9H5V7 419 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM27Q9HBJ8 222 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRLF2Q9HC73 371 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC13A4Q9UKG4 626 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE5AO76074 875 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV3-15P01624 115 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4A8P0C604 315 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBR1P16152 277 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPX2P18283 190 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP4BP51164 291 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD13AQ14CX5 517 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADIPOQQ15848 244 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEACAM16Q2WEN9 425 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2M2Q96R28 347 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC61A2Q9H9S3 476 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBN3Q75N90 2809 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFS8O00217 210 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINB7O75635 380 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AQP1P29972 269 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALCRP30988 508 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SQLEQ14534 574 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1Q1Q15612 314 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFNB3Q15768 340 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UEVLDQ8IX04 471 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM123Q8N131 208 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6S1Q8NH40 331 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPYCQ99645 322 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIMREGQ9BSJ6 248 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAB1Q9NY15 2570 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CUBNO60494 3623 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A087WUJ7 227 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CELA3BP08861 270 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV4-31P0DP07 118 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIPK4Q8NE63 616 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP37Q8NFH4 326 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASPNQ9BXN1 380 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM160Q9NX00 188 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0B4J2E0 115 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GX12 115 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VWC2LB2RUY7 222 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MS4A18H0YCH9 400 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HPRP00739 348 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM157CP0CG43 387 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARR3P36575 388 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HGFACQ04756 655 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GGTLC2Q14390 218 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADRM1Q16186 407 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARTPTQ16568 116 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MS4A18Q3C1V0 323 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC36Q8IYA8 594 aa22.72■■□□□ 1.23
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