RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLDN24	A6NM45	220 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651		A8MT66	165 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	AP3D1	O14617	1153 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	STX16	O14662	325 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	FCMR	O60667	390 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	HLA-H	P01893	362 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBL4A	P11441	157 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAK	P20794	623 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	P2RY4	P51582	365 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIGF	Q07326	219 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CBFB	Q13951	182 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	DCST2	Q5T1A1	773 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	KDM8	Q8N371	416 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4F5	Q8NH21	305 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM45B	Q96B21	275 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	DIRC2	Q96SL1	478 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPA33	Q99795	319 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	DUSP13	Q9UII6	198 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	AUP1	Q9Y679	476 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		7.27	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TTC36	A6NLP5	189 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDPK1	O15530	556 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLPX	O76031	633 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OTC	P00480	354 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF35	P13682	527 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF12	P17014	697 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CD80	P33681	288 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAD52	P43351	418 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP4B	P51164	291 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLC	Q05315	142 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	FXN	Q16595	210 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPIN4	Q56A73	249 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	NIPAL3	Q6P499	406 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	USP51	Q70EK9	711 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPAT4	Q86UL3	456 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	METTL6	Q8TCB7	284 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ST8SIA1	Q92185	356 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDKL2	Q92772	493 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZG16B	Q96DA0	208 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB39B	Q96DA2	213 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PBK	Q96KB5	322 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR51B6	Q9H340	312 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIGU	Q9H490	435 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ULK1	O75385	1050 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	UGT2B17	O75795	530 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRT33A	O76009	404 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	NDUFA7	O95182	113 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	MPIG6B	O95866	241 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PATE4	P0C8F1	98 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSD3B1	P14060	373 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP6V1C1	P21283	382 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSD3B2	P26439	372 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	LCN1	P31025	176 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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