RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	NPIPB7	O75200	414 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT33A	O76009	404 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV3-15	P01624	115 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINE1	P05121	402 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	PGR	P06401	933 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	TACSTD2	P09758	323 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	NR2F1	P10589	423 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	DAO	P14920	347 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	UQCRB	P14927	111 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGA2	P17301	1181 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	CXCR1	P25024	350 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	S100A3	P33764	101 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	THBS4	P35443	961 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	MVD	P53602	400 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	SQLE	Q14534	574 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIP10	Q15642	601 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK20	Q8IZL9	346 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	KDM8	Q8N371	416 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	CADM2	Q8N3J6	435 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	NUP37	Q8NFH4	326 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	PANX1	Q96RD7	426 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX18	Q96RF0	628 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	PIF1	Q9H611	641 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM129	A0AVI4	362 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MVM7	634 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC14L2	O76054	403 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF432	O94892	652 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	MYZAP	P0CAP1	466 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	LYNX1	P0DP58	116 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	PNMT	P11086	282 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	LBP	P18428	481 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	VSNL1	P62760	191 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	GNA13	Q14344	377 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTA3	Q16772	222 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	MSMP	Q1L6U9	139 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM225	Q6GV28	225 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	OGFOD2	Q6N063	350 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	DOK1	Q99704	481 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	AIG1	Q9NVV5	245 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	HAO1	Q9UJM8	370 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	DYSF	O75923	2080 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	SDHD	O14521	159 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	TCF21	O43680	179 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	VAMP5	O95183	116 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	BCHE	P06276	602 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	ETFA	P13804	333 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	NPR2	P20594	1047 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	BGN	P21810	368 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC1A6	P48664	564 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	CHN2	P52757	468 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	CDH15	P55291	814 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN17	P56750	224 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	EGR4	Q05215	589 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	RIN1	Q13671	783 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNI	Q14094	377 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	LIN52	Q52LA3	116 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF220	Q5VTB9	566 aa		10.32	□□□□□ -0.76

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