RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183		A0A1B0GX12	115 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	CCDC160	A6NGH7	325 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	SCD	O00767	359 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	T	O15178	435 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	KLF4	O43474	513 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	MPZL2	O60487	215 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ADAM11	O75078	769 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ICOSLG	O75144	302 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	REM1	O75628	298 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	SP1	P08047	785 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	HPGD	P15428	266 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	GABRB1	P18505	474 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	IL12B	P29460	328 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	LCN1	P31025	176 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	CSNK2B	P67870	215 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	LTB	Q06643	244 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	PMS2P3	Q13401	168 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	TUBA3C	Q13748	450 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	GINS1	Q14691	196 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	OR1C1	Q15619	314 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	BTBD16	Q32M84	506 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ZBED5	Q49AG3	693 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	CASP12	Q6UXS9	341 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	CADM2	Q8N3J6	435 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	AMER2	Q8N7J2	671 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	MDS2	Q8NDY4	140 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	PFN4	Q8NHR9	129 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM239	Q8WW34	195 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	C8orf44	Q96CB5	159 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ADO	Q96SZ5	270 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	TRIM2	Q9C040	744 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	DUSP21	Q9H596	190 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	MMP25	Q9NPA2	562 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	CLN6	Q9NWW5	311 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	RTTN	Q86VV8	2226 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	DNAJC13	O75165	2243 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	UNC119B	A6NIH7	251 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183		H3BSA7	217 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	OIP5	O43482	229 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	RGS10	O43665	173 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	CHP2	O43745	196 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	TSPAN2	O60636	221 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ENTPD6	O75354	484 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	MT-ND2	P03891	347 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	TPO	P07202	933 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	UBL4A	P11441	157 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	IFI30	P13284	250 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	MAK	P20794	623 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	EPHA1	P21709	976 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	TBXA2R	P21731	343 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	NME2	P22392	152 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	MAP2K4	P45985	399 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	GIPR	P48546	466 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	CYB561	P49447	251 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	GPR143	P51810	404 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	NUDT6	P53370	316 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	RNF4	P78317	190 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	SLC35A2	P78381	396 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	CDK5	Q00535	292 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	SKP2	Q13309	424 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	RAB39A	Q14964	217 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	CD226	Q15762	336 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RACK1-231	ENST00000514183	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		6.04	□□□□□ -1.44

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