RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 GRPRP30550 384 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 SFRP5Q5T4F7 317 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 DEF8Q6ZN54 512 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 CBLL1Q75N03 491 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 VTCN1Q7Z7D3 282 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 GPAT4Q86UL3 456 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 TMEM200AQ86VY9 491 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 KDM8Q8N371 416 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 ZNF417Q8TAU3 575 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 TMEM45BQ96B21 275 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 APH1AQ96BI3 265 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 SLC41A3Q96GZ6 507 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 EPYCQ99645 322 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 PRSS27Q9BQR3 290 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 MED18Q9BUE0 208 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 ZNF426Q9BUY5 554 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 OR10A4Q9H209 315 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 FANCFQ9NPI8 374 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-206ENST00000443528 CD300AQ9UGN4 299 aa13.9□□□□□ -0.18
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ACTB-206ENST00000443528 RASD1Q9Y272 281 aa13.9□□□□□ -0.18
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ACTB-206ENST00000443528 SIAH2O43255 324 aa13.89□□□□□ -0.19
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ACTB-206ENST00000443528 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 SERPINA1P01009 418 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 IGHV3-9P01782 118 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 IGHV1-2P23083 117 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 ITGADQ13349 1161 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 P2RY6Q15077 328 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 POU4F3Q15319 338 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 FBXW9Q5XUX1 488 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 CASP12Q6UXS9 341 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 CREB3L2Q70SY1 520 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 EPHX4Q8IUS5 362 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 FAM156AQ8NDB6 213 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 LZICQ8WZA0 190 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 MPP4Q96JB8 637 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 MOGAT1Q96PD6 335 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 HDHD5Q9BXW7 423 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa13.89□□□□□ -0.19
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ACTB-206ENST00000443528 ACTR6Q9GZN1 396 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 B3GAT1Q9P2W7 334 aa13.89□□□□□ -0.19
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ACTB-206ENST00000443528 MPDZO75970 2070 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 FREM1Q5H8C1 2179 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 DEFB108AA8MXU0 73 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 MS4A18H0YCH9 400 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 CASKO14936 926 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 LYZL6O75951 148 aa13.88□□□□□ -0.19
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ACTB-206ENST00000443528 ZNF682O95780 498 aa13.88□□□□□ -0.19
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ACTB-206ENST00000443528 T-ENOLP0DO92 83 aa13.88□□□□□ -0.19
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ACTB-206ENST00000443528 CRYGSP22914 178 aa13.88□□□□□ -0.19
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ACTB-206ENST00000443528 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 TAS2R41P59536 307 aa13.88□□□□□ -0.19
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ACTB-206ENST00000443528 MS4A18Q3C1V0 323 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 GLYATQ6IB77 296 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 NKAIN4Q8IVV8 208 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 STEAP2Q8NFT2 490 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 FAM162AQ96A26 154 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 S100PBPQ96BU1 408 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 NSL1Q96IY1 281 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 OXGR1Q96P68 337 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 CDRT15Q96T59 188 aa13.88□□□□□ -0.19
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ACTB-206ENST00000443528 SLC7A10Q9NS82 523 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 PARPBPQ9NWS1 579 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 ZNF226Q9NYT6 803 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 MALT1Q9UDY8 824 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 A4GNTQ9UNA3 340 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.88□□□□□ -0.19
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ACTB-206ENST00000443528 HPRP00739 348 aa13.87□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 MFSD13AQ14CX5 517 aa13.87□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 TSPO2Q5TGU0 170 aa13.87□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 C16orf89Q6UX73 402 aa13.87□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 AAED1Q7RTV5 226 aa13.87□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 CDC20BQ86Y33 519 aa13.87□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 DEFB107AQ8IZN7 70 aa13.87□□□□□ -0.19
ACTB-206ENST00000443528 UBE2J2Q8N2K1 259 aa13.87□□□□□ -0.19
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