RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MEIOB	Q8N635	442 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	LIPH	Q8WWY8	451 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	UCN2	Q96RP3	112 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CLCA1	A8K7I4	914 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667		M0R082	166 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	DNPH1	O43598	174 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OR7A10	O76100	309 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	AQP8	O94778	261 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CCNB2	O95067	398 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CH25H	O95992	272 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	IFI30	P13284	250 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ANPEP	P15144	967 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ENPP1	P22413	925 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FPR3	P25089	353 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GRPR	P30550	384 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	UQCRC1	P31930	480 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GSS	P48637	474 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	RAC3	P60763	192 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OR7A5	Q15622	319 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FAHD1	Q6P587	224 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PIGX	Q8TBF5	258 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	RNF128	Q8TEB7	428 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SGTB	Q96EQ0	304 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FKRP	Q9H9S5	495 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TINAG	Q9UJW2	476 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	AQP7P3	A6NL99	342 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SULT2B1	O00204	365 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OR10H3	O60404	316 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	E2F6	O75461	281 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TGM6	O95932	706 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	HPR	P00739	348 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MT-ATP6	P00846	226 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TPO	P07202	933 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ABO	P16442	354 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	UQCRFS1	P47985	274 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PPP2R2B	Q00005	443 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	RIPK1	Q13546	671 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PON3	Q15166	354 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	WLS	Q5T9L3	541 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OSTF1	Q92882	214 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FEV	Q99581	238 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF175	Q9Y473	711 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A1W2PNV4	684 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PDLIM1	O00151	329 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GNGT2	O14610	69 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61

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