RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	IMPDH2	P12268	514 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	HPGD	P15428	266 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	DDC	P20711	480 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	GDNF	P39905	211 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAG2	P55895	527 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM33	P57088	247 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2B6	P58173	313 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MERTK	Q12866	999 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYT14P1	Q58G82	188 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	C16orf87	Q6PH81	154 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF614	Q8N883	585 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYT14	Q8NB59	555 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC25A28	Q96A46	364 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNA7	Q96RP8	456 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CPNE1	Q99829	537 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	NUP50	Q9UKX7	468 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651		J3QLI3	93 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	UPK3A	O75631	287 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYP7B1	O75881	506 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEC14L2	O76054	403 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SBK3	P0C264	359 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARL4C	P56559	192 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	H3F3A	P84243	136 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	NPRL3	Q12980	569 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	DAG1	Q14118	895 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAF9	Q16594	264 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPRN	Q5BIV9	151 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SZRD1	Q7Z422	152 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MISP	Q8IVT2	679 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	COX18	Q8N8Q8	333 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIF18A	Q8NI77	898 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC39	Q96DD0	335 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIRREL1	Q96J84	757 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MARCH7	Q9H992	704 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	BRF2	Q9HAW0	419 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TIMM22	Q9Y584	194 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYCE1L	A8MT33	242 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLDN34	H7C241	214 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651		M0R233	179 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYNGR3	O43761	229 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLPTM1	O96005	669 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGKV3-15	P01624	115 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SELENOP	P49908	381 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	LOXL3	P58215	753 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCL8	P80075	99 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC17A1	Q14916	467 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MROH9	Q5TGP6	573 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MDP1	Q86V88	176 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM99	Q8N816	258 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5W2	Q8NH69	310 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIGX	Q8TBF5	258 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB8B	Q92930	207 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		7.31	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.4 ms