RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HDDC3-201ENST00000330334 NUDT7P0C024 238 aa15.6■□□□□ 0.09
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HDDC3-201ENST00000330334 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
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HDDC3-201ENST00000330334 OR6C65A6NJZ3 312 aa15.58■□□□□ 0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 ARAFP10398 606 aa15.58■□□□□ 0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 SLC17A5Q9NRA2 495 aa15.58■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC167Q9P0B6 97 aa15.58■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 SLAMF8Q9P0V8 285 aa15.58■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 CORO2BQ9UQ03 480 aa15.58■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 RASD1Q9Y272 281 aa15.58■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 AMDHD2Q9Y303 409 aa15.58■□□□□ 0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa15.57■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 TNK1Q13470 666 aa15.57■□□□□ 0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 TTMPQ5BVD1 217 aa15.57■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 PAGE3Q5JUK9 113 aa15.57■□□□□ 0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa15.57■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 C5orf46Q6UWT4 87 aa15.57■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 DNM1P46Q6ZS02 220 aa15.57■□□□□ 0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 RABEP2Q9H5N1 569 aa15.57■□□□□ 0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 OBP2BQ9NPH6 170 aa15.57■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 ADPRHL2Q9NX46 363 aa15.57■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 VAPAQ9P0L0 249 aa15.57■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 JMJD1CQ15652 2540 aa15.56■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 FTCDNL1E5RQL4 147 aa15.56■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 E7EQL1 145 aa15.56■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 AHSA1O95433 338 aa15.56■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 TTKP33981 857 aa15.56■□□□□ 0.08
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF83P51522 516 aa15.56■□□□□ 0.08
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