RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	CTAGE8	P0CG41	777 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	EBAG9	O00559	213 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	HSPA4	P34932	840 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	RBSN	Q9H1K0	784 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	NUCB1	Q02818	461 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	RICTOR	Q6R327	1708 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	N4BP3	O15049	544 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	VPS18	Q9P253	973 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	TYRO3	Q06418	890 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	SYT1	P21579	422 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	TSC1	Q92574	1164 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	GLI2	P10070	1586 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	MYO1B	O43795	1136 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	PAF1	Q8N7H5	531 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	AKR1B10	O60218	316 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	ABCC3	O15438	1527 aa		13.46	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.46	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		13.46	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	CEP112	Q8N8E3	955 aa		13.46	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	BRF1	Q92994	677 aa		13.46	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		13.46	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.46	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
FAM200B-223	ENST00000622362	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	ZEB2	O60315	1214 aa		13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	MYZAP	P0CAP1	466 aa		13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	SYK	P43405	635 aa		13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	ABCC11	Q96J66	1382 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	HSF2BP	O75031	334 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	F13A1	P00488	732 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	USP5	P45974	858 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	IDE	P14735	1019 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF213	O14771	459 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	NAPB	Q9H115	298 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM200B-223	ENST00000622362	NOS1	P29475	1434 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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