RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598968.5

TIMM44-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, human

TSL 3

Gene TIMM44, Length 797 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM44-208	ENST00000598968	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	28.74	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968		H7C1W4	665 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	BEND3	Q5T5X7	828 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	TAF1	P21675	1872 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	PTPRC	P08575	1304 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
TIMM44-208	ENST00000598968	SP8	Q8IXZ3	490 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	SLC51A	Q86UW1	340 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	TMC4	Q7Z404	712 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	PSMD1	Q99460	953 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	ALDH1L1	O75891	902 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	CTSW	P56202	376 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	CASP7	P55210	303 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	SNED1	Q8TER0	1413 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	MPND	Q8N594	471 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TIMM44-208	ENST00000598968	MYH3	P11055	1940 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	GRM8	O00222	908 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	GREM2	Q9H772	168 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	GLTPD2	A6NH11	291 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	COL4A1	P02462	1669 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	JDP2	Q8WYK2	163 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
TIMM44-208	ENST00000598968	PPIP5K2	O43314	1243 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	CSF1R	P07333	972 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	GPSM2	P81274	684 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	FOXO4	P98177	505 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	KIF16B	Q96L93	1317 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	VPS33B	Q9H267	617 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	RRAGC	Q9HB90	399 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	RTL9	Q8NET4	1388 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	ITGA6	P23229	1130 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	AOC3	Q16853	763 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	KIF3C	O14782	793 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	BCAR3	O75815	825 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM161A	Q3B820	660 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	NIM1K	Q8IY84	436 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	C6orf229	H3BNL8	230 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	FZD9	O00144	591 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
TIMM44-208	ENST00000598968	UTY	O14607	1347 aa		28.51	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		28.51	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	SUCLG2	Q96I99	432 aa		28.51	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	SPEF2	Q9C093	1822 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	POLL	Q9UGP5	575 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	WASHC4	Q2M389	1173 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	EYA3	Q99504	573 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	USP44	Q9H0E7	712 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	COL4A5	P29400	1685 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	RIMBP2	O15034	1052 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
TIMM44-208	ENST00000598968	C1QTNF8	P60827	252 aa		28.48	■■■□□ 2.15

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