RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 SMARCE1Q969G3 411 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 GBP6Q6ZN66 633 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ATRNO75882 1429 aa9.09□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CPP00450 1065 aa9.09□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP9Q49MG5 647 aa9.09□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 MAFGO15525 162 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM37O94972 964 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 COG3Q96JB2 828 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ELP1O95163 1332 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NEMFO60524 1076 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX11Q96FC9 970 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 PLA2G4AP47712 749 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CORO7P57737 925 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NME9Q86XW9 330 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC125Q86Z20 511 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NEBLO76041 1014 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 RLBP1P12271 317 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 APBA3O96018 575 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.967e-6■■□□□ 11.8
EFTUD2-218ENST00000590367 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP7BP35670 1465 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 IFT172Q9UG01 1749 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NSD2O96028 1365 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 PTGS1P23219 599 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 TUBB4AP04350 444 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CLCN6P51797 869 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 UBXN4Q92575 508 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NRDCO43847 1150 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SETSIPP0DME0 302 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NEDD9Q14511 834 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC186Q7Z3E2 898 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 VEZTQ9HBM0 779 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SLIT2O94813 1529 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CCP110O43303 1012 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 MX1P20591 662 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NF2P35240 595 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ST5P78524 1137 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF2CQ99661 725 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SH3GL3Q99963 347 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 C21orf2O43822 256 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 AMPHP49418 695 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 DDB1Q16531 1140 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF1AQ12756 1690 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NPHP1O15259 732 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SGSM2O43147 1006 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 ETAA1Q9NY74 926 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-218ENST00000590367 CDC45O75419 566 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms