RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 RGMBQ6NW40 437 aa21.64■■□□□ 1.05
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CTDNEP1-211ENST00000575783 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRPA1O75762 1119 aa21.63■■□□□ 1.05
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CTDNEP1-211ENST00000575783 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.63■■□□□ 1.05
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CTDNEP1-211ENST00000575783 MICALL2Q8IY33 904 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNF186Q9NXI6 227 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SP8Q8IXZ3 490 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCDC102AQ96A19 550 aa21.61■■□□□ 1.05
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CTDNEP1-211ENST00000575783 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.6■■□□□ 1.05
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CTDNEP1-211ENST00000575783 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 YDJCA8MPS7 323 aa21.59■■□□□ 1.05
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CTDNEP1-211ENST00000575783 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-211ENST00000575783 DPF2Q92785 391 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CSRNP1Q96S65 589 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 NUP98P52948 1817 aa21.54■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-211ENST00000575783 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 RIMBP2O15034 1052 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 WASHC4Q2M389 1173 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 NEFMP07197 916 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC10A3P09131 477 aa21.51■■□□□ 1.03
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CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF428Q96B54 188 aa21.5■■□□□ 1.03
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CTDNEP1-211ENST00000575783 C6orf229H3BNL8 230 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PDIA6Q15084 440 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DOK7Q18PE1 504 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PROSER3Q2NL68 480 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMC4Q7Z404 712 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 GGA3Q9NZ52 723 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDCA5Q96FF9 252 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ECE2O60344 883 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 COPS6Q7L5N1 327 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 POLLQ9UGP5 575 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 TBC1D8O95759 1140 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-211ENST00000575783 NECTIN2Q92692 538 aa21.44■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-211ENST00000575783 GPSM2P81274 684 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 TCIRG1Q13488 830 aa21.43■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 RTL9Q8NET4 1388 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 EYA3Q99504 573 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 SCARF1Q14162 830 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 G3V3G9 751 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.39■■□□□ 1.01
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