RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 CTSWP56202 376 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 ABCC12Q96J65 1359 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 SRGAP3O43295 1099 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 IGHDP01880 384 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 ST5P78524 1137 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-210ENST00000568388 POLD1P28340 1107 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 NLRP3Q96P20 1036 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 RTL9Q8NET4 1388 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 NPHP1O15259 732 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 DCTPP1Q9H773 170 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 COPRSQ9NQ92 184 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 SMC5Q8IY18 1101 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 GCC1Q96CN9 775 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 GREM2Q9H772 168 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-210ENST00000568388 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 CRY2Q49AN0 593 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 KLHL34Q8N239 644 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 ITGA6P23229 1130 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 YY1P25490 414 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 FAM161AQ3B820 660 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 PDE6BP35913 854 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 FBXO3Q9UK99 471 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 TAF1P21675 1872 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 CHD4Q14839 1912 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 RAB11FIP3O75154 756 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-210ENST00000568388 CIAO1O76071 339 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 SPEF2Q9C093 1822 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 EYA2O00167 538 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 SRGNP10124 158 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 UTRNP46939 3433 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 NPR1P16066 1061 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 NUCB1Q02818 461 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 MASTLQ96GX5 879 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 H0YIN7 160 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 GRAPQ13588 217 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 SIL1Q9H173 461 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 COL4A1P02462 1669 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-210ENST00000568388 SASH1O94885 1247 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 ALDH1B1P30837 517 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 GPR162Q16538 588 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC24Q50LG9 513 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-210ENST00000568388 STYK1Q6J9G0 422 aa23.14■■□□□ 1.29
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