RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568252.1

MKRN3-203, Transcript of makorin ring finger protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MKRN3, Length 1,312 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3-203ENST00000568252 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.53■□□□□ 0.88
MKRN3-203ENST00000568252 LINS1Q8NG48 757 aa20.53■□□□□ 0.88
MKRN3-203ENST00000568252 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.53■□□□□ 0.88
MKRN3-203ENST00000568252 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.52■□□□□ 0.88
MKRN3-203ENST00000568252 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 GRAPQ13588 217 aa20.52■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 GCKRQ14397 625 aa20.52■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.52■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 PDE8AO60658 829 aa20.51■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.51■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 COL4A1P02462 1669 aa20.5■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 MYH3P11055 1940 aa20.5■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 H7C1W4 665 aa20.5■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 BBOX1O75936 387 aa20.5■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.5■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 BEND3Q5T5X7 828 aa20.5■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.5■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.49■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 CASP7P55210 303 aa20.48■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.48■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 PSMD1Q99460 953 aa20.48■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.48■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 PTPRCP08575 1304 aa20.47■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.47■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.47■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 SP8Q8IXZ3 490 aa20.47■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.47■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 CTSWP56202 376 aa20.46■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.46■□□□□ 0.87
MKRN3-203ENST00000568252 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 TMC4Q7Z404 712 aa20.45■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.45■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.44■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.44■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 ALDH1L1O75891 902 aa20.43■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.43■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.43■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.43■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 GLTPD2A6NH11 291 aa20.42■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 MPNDQ8N594 471 aa20.42■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 GREM2Q9H772 168 aa20.42■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 COL4A5P29400 1685 aa20.41■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 GRM8O00222 908 aa20.41■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 KIF3CO14782 793 aa20.41■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.41■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 RTL9Q8NET4 1388 aa20.41■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 SPEF2Q9C093 1822 aa20.4■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 LTBP1Q14766 1721 aa20.4■□□□□ 0.86
MKRN3-203ENST00000568252 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.39■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.39■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 CSF1RP07333 972 aa20.38■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.38■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.38■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 RRAGCQ9HB90 399 aa20.38■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 WDR90Q96KV7 1748 aa20.38■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 FZD9O00144 591 aa20.37■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 PPIP5K2O43314 1243 aa20.37■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 GPSM2P81274 684 aa20.37■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 FOXO4P98177 505 aa20.37■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 AOC3Q16853 763 aa20.37■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 FAM161AQ3B820 660 aa20.37■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 JDP2Q8WYK2 163 aa20.37■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 VPS33BQ9H267 617 aa20.37■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.37■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 UTYO14607 1347 aa20.35■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 KIF16BQ96L93 1317 aa20.35■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 ITGA6P23229 1130 aa20.35■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 C1QTNF8P60827 252 aa20.35■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.35■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.34■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 NIM1KQ8IY84 436 aa20.34■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 SUCLG2Q96I99 432 aa20.34■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.34■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 POLLQ9UGP5 575 aa20.34■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 POTECB2RU33 542 aa20.33■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 BCAR3O75815 825 aa20.33■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.33■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 KAZALD1Q96I82 304 aa20.33■□□□□ 0.85
MKRN3-203ENST00000568252 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms