RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 GJA3Q9Y6H8 435 aa29.32■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 CACNA1FO60840 1977 aa29.32■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.31■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 LDHDQ86WU2 507 aa29.31■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 MYD88Q99836 296 aa29.31■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 MYH3P11055 1940 aa29.3■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 EPHX2P34913 555 aa29.3■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 NIM1KQ8IY84 436 aa29.3■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 MPNDQ8N594 471 aa29.28■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 SUPT20HQ8NEM7 779 aa29.28■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.27■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 IL16Q14005 1332 aa29.26■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 DDX58O95786 925 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 VPS33BQ9H267 617 aa29.26■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 SPEF2Q9C093 1822 aa29.25■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 TMC4Q7Z404 712 aa29.25■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 CLEC11AQ9Y240 323 aa29.25■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 JMYQ8N9B5 988 aa29.24■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC191Q8NCU4 936 aa29.24■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 STK31Q9BXU1 1019 aa29.24■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.24■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 SCNN1DP51172 638 aa29.23■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.22■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 PASKQ96RG2 1323 aa29.21■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.21■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 EPS15P42566 896 aa29.21■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 ZNRF3Q9ULT6 936 aa29.21■■■□□ 2.27
PPP4C-212ENST00000567828 PI4KAP2A4QPH2 592 aa29.2■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa29.2■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 CREBZFQ9NS37 354 aa29.2■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 CXCL9Q07325 125 aa29.19■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 KSR2Q6VAB6 950 aa29.19■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 G2E3Q7L622 706 aa29.19■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 SEC31BQ9NQW1 1179 aa29.18■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 TRPM7Q96QT4 1865 aa29.18■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 IGKV5-2P06315 115 aa29.17■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.17■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 PDE8AO60658 829 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 SLC4A2P04920 1241 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 RPS8P62241 208 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 GPSM2P81274 684 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 WDR63Q8IWG1 891 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 RAD17O75943 681 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 CIAPIN1Q6FI81 312 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 CNTROBQ8N137 903 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 SCN9AQ15858 1988 aa29.14■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 YDJCA8MPS7 323 aa29.14■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.14■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 GPRC5DQ9NZD1 345 aa29.14■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 POLLQ9UGP5 575 aa29.14■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
PPP4C-212ENST00000567828 C6orf229H3BNL8 230 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 NEXNQ0ZGT2 675 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 WASHC4Q2M389 1173 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 CDHR2Q9BYE9 1310 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 RIMBP2O15034 1052 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 FLIIQ13045 1269 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM88BA6NKF7 163 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 NEURL1BA8MQ27 555 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 TNIP1Q15025 636 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 DBNDD1Q9H9R9 158 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 PSME4Q14997 1843 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 VAMP4O75379 141 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 TBC1D16Q8TBP0 767 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 CTSWP56202 376 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 CNTNAP1P78357 1384 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP4C-212ENST00000567828 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 IFFO2Q5TF58 517 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 EYA3Q99504 573 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4C-212ENST00000567828 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms