RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561868.1

SPNS1-205, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 441 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-205ENST00000561868 COL4A5P29400 1685 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 PPIP5K2O43314 1243 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 SCNN1DP51172 638 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 LTBP1Q14766 1721 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 BBOX1O75936 387 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 ANXA1P04083 346 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 EPS15P42566 896 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 TSPYL6Q8N831 410 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 NECTIN2Q92692 538 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 COPS6Q7L5N1 327 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 LAMB2P55268 1798 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 LBX1P52954 281 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 TMC4Q7Z404 712 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 SP8Q8IXZ3 490 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 HYPKQ9NX55 129 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 ABCC4O15439 1325 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 AOC3Q16853 763 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 GOLGA2Q08379 1002 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 MPNDQ8N594 471 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 CAPNS2Q96L46 248 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 TNIP1Q15025 636 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 VAMP4O75379 141 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 CXCL9Q07325 125 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 TCIRG1Q13488 830 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 NLRP10Q86W26 655 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-205ENST00000561868 MAP2K2P36507 400 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 GRAPQ13588 217 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 CA12O43570 354 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 CST9Q5W186 159 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 E9PSI1 815 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 TRAF5O00463 557 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 SLFN5Q08AF3 891 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 H7C1D1 291 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 ABHD8Q96I13 439 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 SLC51AQ86UW1 340 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS1-205ENST00000561868 TAF1P21675 1872 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 RAD17O75943 681 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 SLC4A2P04920 1241 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 GRM1Q13255 1194 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 DPF2Q92785 391 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 STK31Q9BXU1 1019 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 WASHC4Q2M389 1173 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SPNS1-205ENST00000561868 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms