RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.68■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.68■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 TAF1P21675 1872 aa23.66■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.66■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.66■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.66■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 COL4A1P02462 1669 aa23.66■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.66■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 SP8Q8IXZ3 490 aa23.65■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 PSMD1Q99460 953 aa23.65■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.65■■□□□ 1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 CASP7P55210 303 aa23.64■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.64■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 CTSWP56202 376 aa23.63■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.63■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPRCP08575 1304 aa23.62■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.62■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.62■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.62■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.61■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TMC4Q7Z404 712 aa23.6■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.59■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.59■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 GLTPD2A6NH11 291 aa23.59■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ALDH1L1O75891 902 aa23.59■■□□□ 1.37
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GCSHP2-201ENST00000560971 MPNDQ8N594 471 aa23.59■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.59■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 GREM2Q9H772 168 aa23.59■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 GRM8O00222 908 aa23.58■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF3CO14782 793 aa23.58■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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GCSHP2-201ENST00000560971 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 COL4A5P29400 1685 aa23.57■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 GPSM2P81274 684 aa23.56■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 AOC3Q16853 763 aa23.56■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.56■■□□□ 1.36
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GCSHP2-201ENST00000560971 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 FOXO4P98177 505 aa23.55■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.55■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.55■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
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GCSHP2-201ENST00000560971 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.54■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 JDP2Q8WYK2 163 aa23.54■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.54■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 RTL9Q8NET4 1388 aa23.53■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 FZD9O00144 591 aa23.53■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 MYH3P11055 1940 aa23.53■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.52■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 BCAR3O75815 825 aa23.52■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 ITGA6P23229 1130 aa23.52■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 C1QTNF8P60827 252 aa23.52■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 POLLQ9UGP5 575 aa23.52■■□□□ 1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 VPS33BQ9H267 617 aa23.51■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 POTECB2RU33 542 aa23.5■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 C6orf229H3BNL8 230 aa23.5■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.5■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 NIM1KQ8IY84 436 aa23.5■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 SUCLG2Q96I99 432 aa23.5■■□□□ 1.35
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GCSHP2-201ENST00000560971 UTYO14607 1347 aa23.5■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.49■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.49■■□□□ 1.35
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GCSHP2-201ENST00000560971 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.49■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 RIMBP2O15034 1052 aa23.48■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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GCSHP2-201ENST00000560971 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.48■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.48■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF16BQ96L93 1317 aa23.48■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.47■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 WASHC4Q2M389 1173 aa23.47■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 LTBP1Q14766 1721 aa23.47■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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