RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560589.5

TLE3-222, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

TSL 5 BASIC

Gene TLE3, Length 3,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-222	ENST00000560589	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	ST18	O60284	1047 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	ANKRD7	Q92527	254 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	FIBP	O43427	364 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	EVA1C	P58658	441 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	FLII	Q13045	1269 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TLE3-222	ENST00000560589	ABCC4	O15439	1325 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	MCC	P23508	829 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	NWD1	Q149M9	1564 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589		A0A0G2JS52	829 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	UBXN4	Q92575	508 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	CYP2C19	P33261	490 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	ST5	P78524	1137 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	PHACTR2	O75167	634 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	TPM1	P09493	284 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	PSMD1	Q99460	953 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	PXDN	Q92626	1479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	TPM3	P06753	285 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	PEX19	P40855	299 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	SGSM3	Q96HU1	749 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	GBP6	Q6ZN66	633 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	CLSTN1	O94985	981 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	MYL6B	P14649	208 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	DONSON	Q9NYP3	566 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	ADAMTS2	O95450	1211 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	PTPRC	P08575	1304 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	CYP27B1	O15528	508 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	SCP2	P22307	547 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	CAMK4	Q16566	473 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TLE3-222	ENST00000560589	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	MCM6	Q14566	821 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	VPS18	Q9P253	973 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	REC8	O95072	547 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	PHKG2	P15735	406 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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