RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-233	ENST00000557667	HAUS7	Q99871	368 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-233	ENST00000557667	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-233	ENST00000557667	BTG4	Q9NY30	223 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-233	ENST00000557667	GNAT2	P19087	354 aa		10.15	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	NECTIN2	Q92692	538 aa		10.15	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	STRN4	Q9NRL3	753 aa		10.15	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	VPS72	Q15906	364 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	SEMA3E	O15041	775 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	MRE11	P49959	708 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	ZMYM6	O95789	1325 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	SLIT2	O94813	1529 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	MYL6B	P14649	208 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	DDIT3	P35638	169 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	SLC5A1	P13866	664 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	GLI3	P10071	1580 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	LAMB2	P55268	1798 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV5-2	P06315	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CSF1R	P07333	972 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	NEK4	P51957	841 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	TMC4	Q7Z404	712 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	KCNQ3	O43525	872 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	PPP2R5B	Q15173	497 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	FBXL16	Q8N461	479 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF609	O15014	1411 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	SEC24B	O95487	1268 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CAVIN2	O95810	425 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CDKL5	O76039	1030 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CASP7	P55210	303 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	APBB1	O00213	710 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	RCAN1	P53805	252 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	MAP4K1	Q92918	833 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	SLC39A6	Q13433	755 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	RUFY3	Q7L099	469 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	MED23	Q9ULK4	1368 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	USP16	Q9Y5T5	823 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	TRAK2	O60296	914 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	TPM3	P06753	285 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	ITGB4	P16144	1822 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	TRDN	Q13061	729 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	WASF1	Q92558	559 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-233	ENST00000557667	TJP1	Q07157	1748 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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