RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		18.29	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	ABCC4	O15439	1325 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	NYX	Q9GZU5	481 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
CS-231	ENST00000552222	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	NUP98	P52948	1817 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	PSMD14	O00487	310 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	MOB2	Q70IA6	237 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	CFAP53	Q96M91	514 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	ANP32C	O43423	234 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	TBC1D8	O95759	1140 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	MPND	Q8N594	471 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	TAF1	P21675	1872 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222		H7C1D1	291 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	RIMBP2	O15034	1052 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	RGL2	O15211	777 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	SLC10A3	P09131	477 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	ANXA1	P04083	346 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	TNIP1	Q15025	636 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	NLRP3	Q96P20	1036 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-231	ENST00000552222	COL4A1	P02462	1669 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	DOK7	Q18PE1	504 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	CCDC102A	Q96A19	550 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	SP8	Q8IXZ3	490 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	RTL9	Q8NET4	1388 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	PROSER3	Q2NL68	480 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	CDCA5	Q96FF9	252 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	VPS33B	Q9H267	617 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	GGA3	Q9NZ52	723 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		18.16	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		18.16	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	NUDC	Q9Y266	331 aa		18.16	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	LAMB2	P55268	1798 aa		18.16	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		18.15	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		18.15	■□□□□ 0.5
CS-231	ENST00000552222	POTEF	A5A3E0	1075 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	BBOX1	O75936	387 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	POLL	Q9UGP5	575 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	PDIA6	Q15084	440 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	DPF2	Q92785	391 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	ECE2	O60344	883 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	GPSM2	P81274	684 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	GRAP	Q13588	217 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	WASHC4	Q2M389	1173 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	NECTIN2	Q92692	538 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	CCDC184	Q52MB2	194 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	SULF1	Q8IWU6	871 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	C6orf229	H3BNL8	230 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-231	ENST00000552222	GPR25	O00155	361 aa		18.1	■□□□□ 0.49

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