RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	EFS	O43281	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	NID1	P14543	1247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	CDK2AP1	O14519	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	SELP	P16109	830 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	ATP10A	O60312	1499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	BACH1	O14867	736 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	RXRB	P28702	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM117A	Q9C073	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	ABCA8	O94911	1581 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007		A6NJY4	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	MDFI	Q99750	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	STRN4	Q9NRL3	753 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL48-208	ENST00000537007	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	GSC2	O15499	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	GOPC	Q9HD26	462 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	LRP6	O75581	1613 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	RGS12	O14924	1447 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	NPAT	Q14207	1427 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	SSTR4	P31391	388 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	SCNN1D	P51172	638 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	MTFR1	Q15390	333 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	PCSK7	Q16549	785 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	BANK1	Q8NDB2	785 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	SYNM	O15061	1565 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	GRIK1	P39086	918 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	ATP10B	O94823	1461 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	EP400	Q96L91	3159 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	FST	P19883	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL48-208	ENST00000537007	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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