RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-217	ENST00000524534	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	NR1I2	O75469	434 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	TAF5L	O75529	589 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	LRMP	Q12912	555 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	MRC1	P22897	1456 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	REST	Q13127	1097 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	SYCP1	Q15431	976 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	C14orf37	Q86TY3	774 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	CAVIN2	O95810	425 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	KCNA6	P17658	529 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	ZNF165	P49910	485 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	CDC25B	P30305	580 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	STK3	Q13188	491 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	KRT32	Q14532	448 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	PXDN	Q92626	1479 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-217	ENST00000524534	JAK2	O60674	1132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	COL15A1	P39059	1388 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	BRF1	Q92994	677 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	SIL1	Q9H173	461 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	TNNT1	P13805	278 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	IQCB1	Q15051	598 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	PDIA6	Q15084	440 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	SARM1	Q6SZW1	724 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24	1e-6	■■□□□ 14.1
PTPRK-217	ENST00000524534	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	ATP5J	P18859	108 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	FEZ1	Q99689	392 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534		Q6ZUG5	572 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534		H3BQV1	296 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	CTAGE5	O15320	804 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	NEMF	O60524	1076 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	SCRN1	Q12765	414 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	GCKR	Q14397	625 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	ZNF609	O15014	1411 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-217	ENST00000524534	PFKFB2	O60825	505 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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