RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516223.1

RNU6-1281P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1281, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1281P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PCSK7Q16549 785 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FAM26DQ5JW98 314 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NAGPAQ9UK23 515 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 USP20Q9Y2K6 914 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 LILRB5O75023 590 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SASH3O75995 380 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RARAP10276 462 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CD163Q86VB7 1156 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 XYLBO75191 536 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CHRNA4P43681 627 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GPLD1P80108 840 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FAM35AQ86V20 835 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 STIM2Q9P246 746 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NRLP54845 237 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ILDR2Q71H61 639 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NUDT8Q8WV74 236 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SEPT3Q9UH03 358 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FAM229AH3BQW9 127 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CPB1P15086 417 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ZAP70P43403 619 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 BAG6P46379 1132 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PERM1Q5SV97 790 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ABTB2Q8N961 1025 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ZBTB39O15060 712 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MMP20O60882 483 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SSFA2P28290 1259 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SOX18P35713 384 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NLRP13Q86W25 1043 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TTC9Q92623 222 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 A0A0A0MRY4 1105 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 APBA3O96018 575 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PSAPP07602 524 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PLAURQ03405 335 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GRIK5Q16478 980 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 HELQQ8TDG4 1101 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GPR152Q8TDT2 470 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NACC1Q96RE7 527 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ADAM23O75077 832 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ELNP15502 786 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SCNN1AP37088 669 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SIK1P57059 783 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RAC1P63000 192 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MSL1Q68DK7 614 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GATA4P43694 442 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GRIK4Q16099 956 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 OR13H1Q8NG92 308 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 J3QW42 95 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PLD4Q96BZ4 506 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 USTQ9Y2C2 406 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1281P-201ENST00000516223 C9orf172C9J069 976 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1281P-201ENST00000516223 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GHRHP01286 108 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SELPP16109 830 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ATCAYQ86WG3 371 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms