RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503586.1

PITX1-203, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 624 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-203ENST00000503586 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29.61■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa29.6■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.6■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 SLC51AQ86UW1 340 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 PSMD1Q99460 953 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 H7C1W4 665 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 BEND3Q5T5X7 828 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 TMC4Q7Z404 712 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 SP8Q8IXZ3 490 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX1-203ENST00000503586 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 TIAM2Q8IVF5 1701 aa29.57■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 SNED1Q8TER0 1413 aa29.56■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 IARSP41252 1262 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 PTPRCP08575 1304 aa29.55■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 CTSWP56202 376 aa29.55■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 GLTPD2A6NH11 291 aa29.54■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 DPY19L2Q6NUT2 758 aa29.54■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 SEC31BQ9NQW1 1179 aa29.54■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 TAF1P21675 1872 aa29.53■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 RPS8P62241 208 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 MPNDQ8N594 471 aa29.53■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.53■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 NMRK2Q9NPI5 230 aa29.53■■■□□ 2.32
PITX1-203ENST00000503586 ALDH1L1O75891 902 aa29.51■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 CASP7P55210 303 aa29.51■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 SUPT20HQ8NEM7 779 aa29.51■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 TTLL11Q8NHH1 800 aa29.51■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 JDP2Q8WYK2 163 aa29.5■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 KIF3CO14782 793 aa29.49■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 LARGE2Q8N3Y3 721 aa29.49■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 PLA2G12BQ9BX93 195 aa29.49■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 RRAGCQ9HB90 399 aa29.49■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa29.48■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 GREM2Q9H772 168 aa29.48■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.47■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 GRM8O00222 908 aa29.47■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 PPIP5K2O43314 1243 aa29.47■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 COL4A1P02462 1669 aa29.47■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 C1QTNF8P60827 252 aa29.45■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 AOC3Q16853 763 aa29.45■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 VPS33BQ9H267 617 aa29.45■■■□□ 2.31
PITX1-203ENST00000503586 MYH3P11055 1940 aa29.45■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 RTL9Q8NET4 1388 aa29.44■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 NIM1KQ8IY84 436 aa29.44■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 LRRC37AA6NMS7 1700 aa29.44■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 FZD9O00144 591 aa29.43■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 GPSM2P81274 684 aa29.43■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 CSF1RP07333 972 aa29.42■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 ZNF541Q9H0D2 1346 aa29.42■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 C6orf229H3BNL8 230 aa29.41■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 ITGA6P23229 1130 aa29.41■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 EIF6P56537 245 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 FAM161AQ3B820 660 aa29.41■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa29.41■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.41■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 FOXO4P98177 505 aa29.4■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.4■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 COL4A5P29400 1685 aa29.39■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 KIF16BQ96L93 1317 aa29.39■■■□□ 2.3
PITX1-203ENST00000503586 TOMM70O94826 608 aa29.38■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 WASHC4Q2M389 1173 aa29.38■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 POLLQ9UGP5 575 aa29.38■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 TBC1D16Q8TBP0 767 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 EYA3Q99504 573 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 UFL1O94874 794 aa29.36■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.36■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 SUCLG2Q96I99 432 aa29.36■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 MPHOSPH8Q99549 860 aa29.36■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 GGA1Q9UJY5 639 aa29.36■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 GJA3Q9Y6H8 435 aa29.36■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 WDR90Q96KV7 1748 aa29.36■■■□□ 2.29
PITX1-203ENST00000503586 RIMBP2O15034 1052 aa29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.4 ms