RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.66□□□□□ -0.06
NISCH-211ENST00000488243 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NISCH-211ENST00000488243 GPTP24298 496 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-211ENST00000488243 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NISCH-211ENST00000488243 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-211ENST00000488243 MEIS3Q99687 375 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-211ENST00000488243 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-211ENST00000488243 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-211ENST00000488243 NFIXQ14938 502 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 SUSD4Q5VX71 490 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 NTSR2O95665 410 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 LMNB1P20700 586 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 CASP7P55210 303 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 GLTPD2A6NH11 291 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 PDE8AO60658 829 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 HMMRO75330 724 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 SERPINB2P05120 415 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 MTX1Q13505 466 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 ST5P78524 1137 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 TTLL6Q8N841 843 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 CNBD1Q8NA66 436 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 FAM89AQ96GI7 184 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 NPHP1O15259 732 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 ATP8B2P98198 1209 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 SUCLG2Q96I99 432 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-211ENST00000488243 NFKBIEO00221 500 aa14.58□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 CSF1RP07333 972 aa14.58□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 NLRP3Q96P20 1036 aa14.58□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 H0YIN7 160 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 FOXN1O15353 648 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 CTSWP56202 376 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 FOXO4P98177 505 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 CEP85Q6P2H3 762 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 RTL9Q8NET4 1388 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 POTECB2RU33 542 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 ERFEQ4G0M1 354 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 SSH3Q8TE77 659 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 KAZALD1Q96I82 304 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 FBXO3Q9UK99 471 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 FAM177BA6PVY3 158 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 PDE6BP35913 854 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 CREBZFQ9NS37 354 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 LAMB2P55268 1798 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 SRGAP3O43295 1099 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 C21orf2O43822 256 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 POLA2Q14181 598 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 CRY2Q49AN0 593 aa14.53□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 GCC1Q96CN9 775 aa14.53□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.53□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.53□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.53□□□□□ -0.08
NISCH-211ENST00000488243 ABCC12Q96J65 1359 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms