RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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PTPRD-211ENST00000486161 VPS53Q5VIR6 699 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-211ENST00000486161 SKAP1Q86WV1 359 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-211ENST00000486161 IFT172Q9UG01 1749 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-211ENST00000486161 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-211ENST00000486161 H0YIN7 160 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-211ENST00000486161 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-211ENST00000486161 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
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PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRD-211ENST00000486161 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
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PTPRD-211ENST00000486161 PLCB2Q00722 1185 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-211ENST00000486161 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-211ENST00000486161 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF213O14771 459 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-211ENST00000486161 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
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PTPRD-211ENST00000486161 XAGE2Q96GT9 111 aa9.79□□□□□ -0.84
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