RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 GLTPD2A6NH11 291 aa24.28■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 GCKRQ14397 625 aa24.28■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.28■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 F6X3S4 739 aa24.27■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 TMC4Q7Z404 712 aa24.27■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 C1QTNF8P60827 252 aa24.26■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 BEND3Q5T5X7 828 aa24.26■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.26■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 CASP7P55210 303 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 VPS33BQ9H267 617 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.23■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.22■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.22■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 RRAGCQ9HB90 399 aa24.22■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.22■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 FZD9O00144 591 aa24.21■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 CTSWP56202 376 aa24.21■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 MPNDQ8N594 471 aa24.21■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.21■■□□□ 1.47
NISCH-209ENST00000485765 TAF1P21675 1872 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 PTPRCP08575 1304 aa24.19■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 COL4A1P02462 1669 aa24.19■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 POTECB2RU33 542 aa24.19■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 RTL9Q8NET4 1388 aa24.18■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 ALDH1L1O75891 902 aa24.18■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 CSF1RP07333 972 aa24.18■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 TOMM70O94826 608 aa24.17■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 JDP2Q8WYK2 163 aa24.17■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.16■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.16■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.16■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 COL4A5P29400 1685 aa24.15■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.15■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 GREM2Q9H772 168 aa24.15■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.15■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.15■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.14■■□□□ 1.46
NISCH-209ENST00000485765 GRM8O00222 908 aa24.14■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 PPIP5K2O43314 1243 aa24.14■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 GPSM2P81274 684 aa24.14■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.14■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 AOC3Q16853 763 aa24.14■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.14■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 WDR90Q96KV7 1748 aa24.14■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.14■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 FOXO4P98177 505 aa24.13■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 POLLQ9UGP5 575 aa24.12■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.12■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 UTYO14607 1347 aa24.11■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 GPC2Q8N158 579 aa24.11■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 NIM1KQ8IY84 436 aa24.1■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.1■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.1■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 ITGA6P23229 1130 aa24.09■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 MYH3P11055 1940 aa24.09■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 WASHC4Q2M389 1173 aa24.08■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.08■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.08■■□□□ 1.45
NISCH-209ENST00000485765 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.08■■□□□ 1.44
NISCH-209ENST00000485765 LTBP1Q14766 1721 aa24.07■■□□□ 1.44
NISCH-209ENST00000485765 C6orf229H3BNL8 230 aa24.07■■□□□ 1.44
NISCH-209ENST00000485765 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
NISCH-209ENST00000485765 FAM161AQ3B820 660 aa24.07■■□□□ 1.44
NISCH-209ENST00000485765 KAZALD1Q96I82 304 aa24.07■■□□□ 1.44
NISCH-209ENST00000485765 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.06■■□□□ 1.44
NISCH-209ENST00000485765 FSTL1Q12841 308 aa24.06■■□□□ 1.44
NISCH-209ENST00000485765 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.06■■□□□ 1.44
NISCH-209ENST00000485765 EYA3Q99504 573 aa24.06■■□□□ 1.44
NISCH-209ENST00000485765 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.06■■□□□ 1.44
NISCH-209ENST00000485765 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
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