RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.01■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.01■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 MPNDQ8N594 471 aa22.01■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.01■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.01■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 VPS33BQ9H267 617 aa22.01■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF853P0CG23 659 aa22■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 VEGFBP49765 207 aa22■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM89AQ96GI7 184 aa22■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 APAF1O14727 1248 aa21.99■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 CXCL9Q07325 125 aa21.99■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 HYPKQ9NX55 129 aa21.99■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.114e-6■□□□□ 9.3
SKIV2L-211ENST00000485349 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.98■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.98■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 IFT57Q9NWB7 429 aa21.97■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 RASSF10A6NK89 507 aa21.96■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 FOXN1O15353 648 aa21.96■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 CAPN15O75808 1086 aa21.96■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SKIV2L-211ENST00000485349 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.95■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 TMC4Q7Z404 712 aa21.95■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 TRAF5O00463 557 aa21.94■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 RAD17O75943 681 aa21.94■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 GNAI1P63096 354 aa21.94■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 GOLGA2Q08379 1002 aa21.94■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.94■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.94■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 YDJCA8MPS7 323 aa21.93■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.92■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.92■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 TNIP1Q15025 636 aa21.91■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.91■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 AIDAQ96BJ3 306 aa21.91■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 GPSM2P81274 684 aa21.9■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 CST9Q5W186 159 aa21.9■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 MYD88Q99836 296 aa21.9■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.9■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 WBP1LQ9NX94 342 aa21.9■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SKIV2L-211ENST00000485349 SHTN1A0MZ66 631 aa21.89■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.89■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 POLLQ9UGP5 575 aa21.89■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 WASHC4Q2M389 1173 aa21.88■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.88■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 SCN9AQ15858 1988 aa21.88■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 RIMBP2O15034 1052 aa21.87■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC184Q52MB2 194 aa21.87■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 SPEF2Q9C093 1822 aa21.86■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 C6orf229H3BNL8 230 aa21.86■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.86■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 TSPYL6Q8N831 410 aa21.86■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.86■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.86■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 MYH3P11055 1940 aa21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 PSMD14O00487 310 aa21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 GRM1Q13255 1194 aa21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 MICALL2Q8IY33 904 aa21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 CAPNS2Q96L46 248 aa21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.85■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 ECE2O60344 883 aa21.84■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.84■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 RTL9Q8NET4 1388 aa21.84■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 PSME4Q14997 1843 aa21.83■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 LBX1P52954 281 aa21.83■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 DOK7Q18PE1 504 aa21.83■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SKIV2L-211ENST00000485349 EYA3Q99504 573 aa21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms