RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 PSMD1Q99460 953 aa20.99■□□□□ 0.95
ATG4B-216ENST00000475195 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
ATG4B-216ENST00000475195 F6X3S4 739 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-216ENST00000475195 CASP7P55210 303 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-216ENST00000475195 TMC4Q7Z404 712 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-216ENST00000475195 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-216ENST00000475195 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-216ENST00000475195 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-216ENST00000475195 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-216ENST00000475195 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-216ENST00000475195 PTPRCP08575 1304 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-216ENST00000475195 TAF1P21675 1872 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 VPS33BQ9H267 617 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 GLTPD2A6NH11 291 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 ALDH1L1O75891 902 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 SLC51AQ86UW1 340 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 CSF1RP07333 972 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 COL4A1P02462 1669 aa20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 CTSWP56202 376 aa20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 RTL9Q8NET4 1388 aa20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 KIF3CO14782 793 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 MPNDQ8N594 471 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-216ENST00000475195 MYH3P11055 1940 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 UTYO14607 1347 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 FZD9O00144 591 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 GRM8O00222 908 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 FOXO4P98177 505 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 GREM2Q9H772 168 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 POTECB2RU33 542 aa20.85■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.85■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 JDP2Q8WYK2 163 aa20.85■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 RRAGCQ9HB90 399 aa20.85■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 COL4A5P29400 1685 aa20.84■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 C1QTNF8P60827 252 aa20.84■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 GPSM2P81274 684 aa20.84■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.84■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.83■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.83■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 KAZALD1Q96I82 304 aa20.83■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 POLLQ9UGP5 575 aa20.83■□□□□ 0.93
ATG4B-216ENST00000475195 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.83■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 LTBP1Q14766 1721 aa20.83■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 WDR90Q96KV7 1748 aa20.83■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 PPIP5K2O43314 1243 aa20.82■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 ITGA6P23229 1130 aa20.82■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 AOC3Q16853 763 aa20.82■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 USP44Q9H0E7 712 aa20.82■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 TOMM70O94826 608 aa20.81■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.81■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.81■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 KIF16BQ96L93 1317 aa20.8■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 WASHC4Q2M389 1173 aa20.8■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.8■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 GPC2Q8N158 579 aa20.8■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 SUCLG2Q96I99 432 aa20.8■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.8■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.79■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 BCAR3O75815 825 aa20.79■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 FAM161AQ3B820 660 aa20.79■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-216ENST00000475195 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms